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麦堂straw

银虫 (小有名气)

[求助] 蛋白质糖基化位点鉴定

在毕赤酵母中新表达一个重组蛋白,已确定其发生了糖基化现象,现想对其进行糖基化位点的鉴定,主要想通过胶内酶解——肽段富集——质谱分析——数据库检索等系列流程,问一下小木虫的各位大侠,有没有做过相关的工作,在国内一般哪个公司或研究机构做的比较好收费便宜?
谢谢各位!
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山有木兮木有枝,心悦君兮君不知。
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凌波丽

专家顾问 (知名作家)

今天就到这里,御姐我今天下午还要去拜访几位重要的客人;楼主愿意与我继续讨论,可以贴出来,不愿意就算了。GOOD LUCK!
9楼2013-04-20 15:01:34
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凌波丽

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【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
麦堂straw: 金币+10, ★★★很有帮助 2013-04-20 18:36:23
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香。期待你的慷慨解囊。快乐每一天 2013-04-22 08:55:40
内容已删除
2楼2013-04-20 11:47:59
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凌波丽

专家顾问 (知名作家)

【答案】应助回帖

更正:“那里设备是MALDI-MS”,我是提笔忘字,
3楼2013-04-20 12:00:59
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凌波丽

专家顾问 (知名作家)

内容已删除
4楼2013-04-20 12:11:20
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麦堂straw

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 凌波丽 at 2013-04-20 11:47:59
质谱鉴定可以比较容易地检测糖基化。你可以找北京大学中心实验楼质谱室,在北京大学医学部2楼,那里设备是MADI-MS,精度还可以收费可能是北京地区最低的,及对北京大学内部服务也对北京大学之外服务。北京大学生物医 ...

感谢回复!可是要分析糖基化位点,貌似是要做肽段谱图,需十分精确,我查询到的公司一般用的都是nano-LC-MS/MS,为纳升级别的,且还需去糖基化酶进行去糖基化。请问你知道具体情况,能做这个吗?
山有木兮木有枝,心悦君兮君不知。
5楼2013-04-20 12:32:02
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凌波丽

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myprayer: 金币+1, 哇菇凉哈哈。赠人玫瑰手有余香 2013-04-22 18:46:12
MALDI-MS可以完成多肽的糖基化、磷酸化、甲基化、乙酰化等各种共价的修饰。具体样品准备你可以和有关实验室和检测中心协商。肽段谱图一般用胰蛋白酶有限水解蛋白质即可,因为肽分子量过大质谱无法精确检测出分子量,到用软件找匹配时结果不唯一。不过糖基的分支点肯定无法直接由MALDI-MS可以测出,必须在样品准备时使用不同的糖基酶有限水解后用MALDI-MS测定后拼装。
6楼2013-04-20 12:41:06
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凌波丽

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引用回帖:
5楼: Originally posted by 麦堂straw at 2013-04-20 12:32:02
感谢回复!可是要分析糖基化位点,貌似是要做肽段谱图,需十分精确,我查询到的公司一般用的都是nano-LC-MS/MS,为纳升级别的,且还需去糖基化酶进行去糖基化。请问你知道具体情况,能做这个吗?...

“要分析糖基化位点,貌似是要做肽段谱图,需十分精确。"不是貌似肽段谱图,而是貌似Ladder Sequencing,即Ediman降解结合质谱测定多肽序列,也就是用质谱代替凝胶电泳测定每一步Ediman降解之后减少一个氨基酸残基分子量的多肽段的相对分子量,但是现在能够用串联质谱直接测定多肽段的氨基酸序列了,不用在结合用Ediman降解。而且许多的多肽的糖基化、磷酸化、甲基化、乙酰化等各种共价的修饰,尤其是磷酸化修饰已经能够直接从质谱读出。但是不幸的是糖分子不是线性分子,而是可能有很多分支。至少在分支位点必须用糖苷酶水解以确定分支的类型,目前的质谱还打不到能够区别糖链不同分支的水平。
7楼2013-04-20 13:42:35
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凌波丽

专家顾问 (知名作家)

【答案】应助回帖

MMB 446 Post-Translational Modifications of Proteins, 2009,2nd Ed,
楼主参考一下了,有具体问题我们还可以自讨论.

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  • 附件 1 : 446_Post-TranslationalModificationsofProteins,2ndEd.pdf
  • 2013-04-20 15:01:50, 10.09 M
8楼2013-04-20 14:55:20
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麦堂straw

银虫 (小有名气)

引用回帖:
9楼: Originally posted by 凌波丽 at 2013-04-20 15:01:34
今天就到这里,御姐我今天下午还要去拜访几位重要的客人;楼主愿意与我继续讨论,可以贴出来,不愿意就算了。GOOD LUCK!

十分不好意思,刚一直做实验,没有及时回复。谢谢你提供的参考信息,我会认真阅读,我之前一直在做克隆,对蛋白修饰质谱分析方面完全是小白,不懂的地方还请多多指教,谢谢!
山有木兮木有枝,心悦君兮君不知。
10楼2013-04-20 18:36:04
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