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落满夏天

银虫 (正式写手)


[交流] 蛋白质原液里那些氨基酸残基容易被氧化?

请问那些蛋白质的氨基酸残基容易被氧化(体外环境下,纯化过程之中),或者有对于蛋白质失活有研究的高手欢迎给小弟指点.如何才能知道蛋白质的活性位点呢?
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ynkuaile

木虫 (小有名气)


★ ★ ★ ★
落满夏天(金币+1): 谢谢参与
amisking: 金币+3, 鼓励积极应助! 2012-03-19 20:18:39
半胱氨酸的巯基容易被氧化,如果活性位点是半胱氨酸,氧化后则失活,如果其他位置的半胱氨酸被氧化,则形成其他二硫键影响蛋白质的空间结构。如何知道是否是活性位点,用半胱氨酸的抑制剂或突变?
2楼2012-03-19 16:40:12
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落满夏天

银虫 (正式写手)


引用回帖:
2楼: Originally posted by ynkuaile at 2012-03-19 16:40:12:
半胱氨酸的巯基容易被氧化,如果活性位点是半胱氨酸,氧化后则失活,如果其他位置的半胱氨酸被氧化,则形成其他二硫键影响蛋白质的空间结构。如何知道是否是活性位点,用半胱氨酸的抑制剂或突变?

我的蛋白里就没有半胱氨酸,我怀疑是其他活性氨基酸的变化,但是不知道怎么确定活性位点。
3楼2012-03-20 11:51:45
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ynkuaile

木虫 (小有名气)


没有半胱氨酸就不用加还原剂了,有时候他活性的变化并不是一个氨基酸贡献的,是活性口袋的多个氨基酸都可能影响,要不你做个DSL或CD,看看结构有没有改变。确定活性位点?做同源摸建或序列比对找保守氨基酸,定点突变,要么看同源的晶体结构。仅供参考。
4楼2012-03-20 12:29:44
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落满夏天

银虫 (正式写手)


引用回帖:
4楼: Originally posted by ynkuaile at 2012-03-20 12:29:44:
没有半胱氨酸就不用加还原剂了,有时候他活性的变化并不是一个氨基酸贡献的,是活性口袋的多个氨基酸都可能影响,要不你做个DSL或CD,看看结构有没有改变。确定活性位点?做同源摸建或序列比对找保守氨基酸,定点突 ...

DSL和CD全称是什么,小弟这些不是很在行,同源建模或序列对比如何做?求详细解答,感激不尽。
5楼2012-03-20 15:30:55
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ynkuaile

木虫 (小有名气)


打错了,DLS,动态光散射。元二色谱。就是可以看蛋白质结构有没有变化,变化后活性会受影响。序列比对就是与同一家族其他属的比较,一般活性位点是保守的氨基酸。
6楼2012-03-20 16:01:26
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songyupin

金虫 (小有名气)



落满夏天(金币+1): 谢谢参与
半胱氨酸,甲硫氨酸,精氨酸,组氨酸都容易被氧化
7楼2012-03-21 08:31:55
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落满夏天

银虫 (正式写手)


引用回帖:
7楼: Originally posted by songyupin at 2012-03-21 08:31:55:
半胱氨酸,甲硫氨酸,精氨酸,组氨酸都容易被氧化

好,有价值,谢谢.
8楼2012-03-21 09:15:33
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