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蛋白质原液里那些氨基酸残基容易被氧化?
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落满夏天
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蛋白质原液里那些氨基酸残基容易被氧化?
请问那些蛋白质的氨基酸残基容易被氧化(体外环境下,纯化过程之中),或者有对于蛋白质失活有研究的高手欢迎给小弟指点.如何才能知道蛋白质的活性位点呢?
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2012-03-19 15:42:44
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ynkuaile
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落满夏天(金币+1): 谢谢参与
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2012-03-19 20:18:39
半胱氨酸的巯基容易被氧化,如果活性位点是半胱氨酸,氧化后则失活,如果其他位置的半胱氨酸被氧化,则形成其他二硫键影响蛋白质的空间结构。如何知道是否是活性位点,用半胱氨酸的抑制剂或突变?
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2楼
2012-03-19 16:40:12
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落满夏天
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ynkuaile
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半胱氨酸的巯基容易被氧化,如果活性位点是半胱氨酸,氧化后则失活,如果其他位置的半胱氨酸被氧化,则形成其他二硫键影响蛋白质的空间结构。如何知道是否是活性位点,用半胱氨酸的抑制剂或突变?
我的蛋白里就没有半胱氨酸,我怀疑是其他活性氨基酸的变化,但是不知道怎么确定活性位点。
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3楼
2012-03-20 11:51:45
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没有半胱氨酸就不用加还原剂了,有时候他活性的变化并不是一个氨基酸贡献的,是活性口袋的多个氨基酸都可能影响,要不你做个DSL或CD,看看结构有没有改变。确定活性位点?做同源摸建或序列比对找保守氨基酸,定点突变,要么看同源的晶体结构。仅供参考。
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4楼
2012-03-20 12:29:44
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ynkuaile
at 2012-03-20 12:29:44:
没有半胱氨酸就不用加还原剂了,有时候他活性的变化并不是一个氨基酸贡献的,是活性口袋的多个氨基酸都可能影响,要不你做个DSL或CD,看看结构有没有改变。确定活性位点?做同源摸建或序列比对找保守氨基酸,定点突 ...
DSL和CD全称是什么,小弟这些不是很在行,同源建模或序列对比如何做?求详细解答,感激不尽。
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5楼
2012-03-20 15:30:55
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ynkuaile
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打错了,DLS,动态光散射。元二色谱。就是可以看蛋白质结构有没有变化,变化后活性会受影响。序列比对就是与同一家族其他属的比较,一般活性位点是保守的氨基酸。
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6楼
2012-03-20 16:01:26
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落满夏天(金币+1): 谢谢参与
半胱氨酸,甲硫氨酸,精氨酸,组氨酸都容易被氧化
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7楼
2012-03-21 08:31:55
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songyupin
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半胱氨酸,甲硫氨酸,精氨酸,组氨酸都容易被氧化
好,有价值,谢谢.
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8楼
2012-03-21 09:15:33
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