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落满夏天

银虫 (正式写手)

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[交流] 蛋白质原液里那些氨基酸残基容易被氧化?

请问那些蛋白质的氨基酸残基容易被氧化(体外环境下,纯化过程之中),或者有对于蛋白质失活有研究的高手欢迎给小弟指点.如何才能知道蛋白质的活性位点呢?

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1楼2012-03-19 15:42:44

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ynkuaile

木虫 (小有名气)

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落满夏天(金币+1): 谢谢参与
amisking: 金币+3, 鼓励积极应助！ 2012-03-19 20:18:39

半胱氨酸的巯基容易被氧化，如果活性位点是半胱氨酸，氧化后则失活，如果其他位置的半胱氨酸被氧化，则形成其他二硫键影响蛋白质的空间结构。如何知道是否是活性位点，用半胱氨酸的抑制剂或突变？

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2楼2012-03-19 16:40:12

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落满夏天

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2楼: Originally posted by ynkuaile at 2012-03-19 16:40:12:
半胱氨酸的巯基容易被氧化，如果活性位点是半胱氨酸，氧化后则失活，如果其他位置的半胱氨酸被氧化，则形成其他二硫键影响蛋白质的空间结构。如何知道是否是活性位点，用半胱氨酸的抑制剂或突变？

我的蛋白里就没有半胱氨酸，我怀疑是其他活性氨基酸的变化，但是不知道怎么确定活性位点。

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3楼2012-03-20 11:51:45

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ynkuaile

木虫 (小有名气)

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没有半胱氨酸就不用加还原剂了，有时候他活性的变化并不是一个氨基酸贡献的，是活性口袋的多个氨基酸都可能影响，要不你做个DSL或CD,看看结构有没有改变。确定活性位点？做同源摸建或序列比对找保守氨基酸，定点突变，要么看同源的晶体结构。仅供参考。

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4楼2012-03-20 12:29:44

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落满夏天

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4楼: Originally posted by ynkuaile at 2012-03-20 12:29:44:
没有半胱氨酸就不用加还原剂了，有时候他活性的变化并不是一个氨基酸贡献的，是活性口袋的多个氨基酸都可能影响，要不你做个DSL或CD,看看结构有没有改变。确定活性位点？做同源摸建或序列比对找保守氨基酸，定点突 ...

DSL和CD全称是什么，小弟这些不是很在行，同源建模或序列对比如何做？求详细解答，感激不尽。

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5楼2012-03-20 15:30:55

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