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kongzhen1985

新虫 (初入文坛)


[交流] 请问有做细菌小RNA方面的虫友吗?

最近要做金葡菌的小RNA,实验室没有人做相关课题的,有做这方面的可以交流的吗?实在 是不知道该怎么下手了,谢谢了先
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kongzhen1985

新虫 (初入文坛)


送红花一朵
引用回帖:
6楼: Originally posted by 沙门小rna at 2013-11-06 11:27:08
你好,我们没有自己设计过,都是信息生物学预测的~难道还可以自己设计出小rna?很有意思。请详细说说~~...

我要设计的是人工设计的反式作用RNA,去干扰靶基因的表达的看看效果如何的,关键是现在网上都是革兰阴性杆菌的设计原则,基本没有葛兰阳性的。还有请问您有没有向外国人要过质粒啊?
7楼2013-11-06 16:47:30
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沙门小rna

金虫 (正式写手)


感谢参与,应助指数 +1
缩++影: 应助指数-1, 非应助回帖请不要选择【确定回帖应助】 2013-11-03 00:11:02
我啊~战友你好~我是这方面的。同学你好~
2楼2013-11-03 00:07:15
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沙门小rna

金虫 (正式写手)


你看我的名字啊。沙门小rna哈哈~
3楼2013-11-03 00:08:11
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沙门小rna

金虫 (正式写手)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
有什么需要讨论的吗~朋友~

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4楼2013-11-03 18:39:53
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kongzhen1985

新虫 (初入文坛)


送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by 沙门小rna at 2013-11-03 18:39:53
有什么需要讨论的吗~朋友~

我想请问下您有没有自己设计过小RNA?
5楼2013-11-06 09:47:34
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沙门小rna

金虫 (正式写手)



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5楼: Originally posted by kongzhen1985 at 2013-11-06 09:47:34
我想请问下您有没有自己设计过小RNA?...

你好,我们没有自己设计过,都是信息生物学预测的~难道还可以自己设计出小rna?很有意思。请详细说说~~

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6楼2013-11-06 11:27:08
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沙门小rna

金虫 (正式写手)



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7楼: Originally posted by kongzhen1985 at 2013-11-06 16:47:30
我要设计的是人工设计的反式作用RNA,去干扰靶基因的表达的看看效果如何的,关键是现在网上都是革兰阴性杆菌的设计原则,基本没有葛兰阳性的。还有请问您有没有向外国人要过质粒啊?...

哈哈,涨姿势了。我们只是利用生物信息学和表型实验调查自然转录小rna的功能。做的是阴性菌。我实验室的一个老师和老外要过质粒的。~~加你好友了~
8楼2013-11-06 18:57:16
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kongzhen1985

新虫 (初入文坛)


引用回帖:
8楼: Originally posted by 沙门小rna at 2013-11-06 18:57:16
哈哈,涨姿势了。我们只是利用生物信息学和表型实验调查自然转录小rna的功能。做的是阴性菌。我实验室的一个老师和老外要过质粒的。~~加你好友了~...

那你们常用的分析DNA或RNA之间的碱基配对及二级结构的预测等等的软件是什么啊?还有如何分析细菌里面小RNA的结构呢?我想自己先看看小RNA的结构然后根据自然小RNA的结构去设计人工合成反式作用RNA,期待您的回复
9楼2013-11-06 20:55:57
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沙门小rna

金虫 (正式写手)



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9楼: Originally posted by kongzhen1985 at 2013-11-06 20:55:57
那你们常用的分析DNA或RNA之间的碱基配对及二级结构的预测等等的软件是什么啊?还有如何分析细菌里面小RNA的结构呢?我想自己先看看小RNA的结构然后根据自然小RNA的结构去设计人工合成反式作用RNA,期待您的 ...

现在我们组貌似二级结构预测分析都是在网上弄的,mfold等,我们自己木有软件~至于rna的二级结构和互补配对这个问题。真心不懂。我只知道反式作用大都是在颈环结构上配对,而有些rna分子压根就不是根据二级结构直接和dna互补的,还需要其他伴侣蛋白参与。不好意思才疏学浅 0 0.人工设计这样的课题我们还没研究过。
10楼2013-11-06 22:57:06
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kongzhen1985

新虫 (初入文坛)


引用回帖:
10楼: Originally posted by 沙门小rna at 2013-11-06 22:57:06
现在我们组貌似二级结构预测分析都是在网上弄的,mfold等,我们自己木有软件~至于rna的二级结构和互补配对这个问题。真心不懂。我只知道反式作用大都是在颈环结构上配对,而有些rna分子压根就不是根据二级结构直接 ...

没事的,那我在研究研究,对于实验中的一些常规步骤如果不会的话到时候还请您多多指教,谢啦
11楼2013-11-07 10:16:46
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沙门小rna

金虫 (正式写手)


引用回帖:
11楼: Originally posted by kongzhen1985 at 2013-11-07 10:16:46
没事的,那我在研究研究,对于实验中的一些常规步骤如果不会的话到时候还请您多多指教,谢啦...

额。互相学习~
12楼2013-11-07 10:24:42
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23SALLY

新虫 (初入文坛)



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请问楼主现在还在做细菌的小RNA吗?可否问你一些问题呢
13楼2016-01-17 09:43:27
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