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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 医学 » 检验 » 请问有做细菌小RNA方面的虫友吗？
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kongzhen1985

新虫 (初入文坛)

[交流] 请问有做细菌小RNA方面的虫友吗？

最近要做金葡菌的小RNA，实验室没有人做相关课题的，有做这方面的可以交流的吗？实在 是不知道该怎么下手了，谢谢了先
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1楼 2013-10-31 20:28:48
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kongzhen1985

新虫 (初入文坛)
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6楼: Originally posted by 沙门小rna at 2013-11-06 11:27:08
你好，我们没有自己设计过，都是信息生物学预测的~难道还可以自己设计出小rna？很有意思。请详细说说~~...

我要设计的是人工设计的反式作用RNA，去干扰靶基因的表达的看看效果如何的，关键是现在网上都是革兰阴性杆菌的设计原则，基本没有葛兰阳性的。还有请问您有没有向外国人要过质粒啊？
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7楼2013-11-06 16:47:30
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沙门小rna

金虫 (正式写手)
感谢参与，应助指数 +1
缩++影: 应助指数-1, 非应助回帖请不要选择【确定回帖应助】 2013-11-03 00:11:02
我啊~战友你好~我是这方面的。同学你好~
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2楼2013-11-03 00:07:15
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沙门小rna

金虫 (正式写手)
你看我的名字啊。沙门小rna哈哈~
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3楼2013-11-03 00:08:11
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沙门小rna

金虫 (正式写手)
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有什么需要讨论的吗~朋友~
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kongzhen1985
4楼2013-11-03 18:39:53
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kongzhen1985

新虫 (初入文坛)
送红花一朵
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4楼: Originally posted by 沙门小rna at 2013-11-03 18:39:53
有什么需要讨论的吗~朋友~

我想请问下您有没有自己设计过小RNA？
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5楼2013-11-06 09:47:34
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沙门小rna

金虫 (正式写手)
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5楼: Originally posted by kongzhen1985 at 2013-11-06 09:47:34
我想请问下您有没有自己设计过小RNA？...

你好，我们没有自己设计过，都是信息生物学预测的~难道还可以自己设计出小rna？很有意思。请详细说说~~
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kongzhen1985
6楼2013-11-06 11:27:08
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沙门小rna

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7楼: Originally posted by kongzhen1985 at 2013-11-06 16:47:30
我要设计的是人工设计的反式作用RNA，去干扰靶基因的表达的看看效果如何的，关键是现在网上都是革兰阴性杆菌的设计原则，基本没有葛兰阳性的。还有请问您有没有向外国人要过质粒啊？...

哈哈，涨姿势了。我们只是利用生物信息学和表型实验调查自然转录小rna的功能。做的是阴性菌。我实验室的一个老师和老外要过质粒的。~~加你好友了~
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8楼2013-11-06 18:57:16
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kongzhen1985

新虫 (初入文坛)
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8楼: Originally posted by 沙门小rna at 2013-11-06 18:57:16
哈哈，涨姿势了。我们只是利用生物信息学和表型实验调查自然转录小rna的功能。做的是阴性菌。我实验室的一个老师和老外要过质粒的。~~加你好友了~...

那你们常用的分析DNA或RNA之间的碱基配对及二级结构的预测等等的软件是什么啊？还有如何分析细菌里面小RNA的结构呢？我想自己先看看小RNA的结构然后根据自然小RNA的结构去设计人工合成反式作用RNA，期待您的回复
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9楼2013-11-06 20:55:57
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沙门小rna

金虫 (正式写手)
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9楼: Originally posted by kongzhen1985 at 2013-11-06 20:55:57
那你们常用的分析DNA或RNA之间的碱基配对及二级结构的预测等等的软件是什么啊？还有如何分析细菌里面小RNA的结构呢？我想自己先看看小RNA的结构然后根据自然小RNA的结构去设计人工合成反式作用RNA，期待您的 ...

现在我们组貌似二级结构预测分析都是在网上弄的，mfold等，我们自己木有软件~至于rna的二级结构和互补配对这个问题。真心不懂。我只知道反式作用大都是在颈环结构上配对，而有些rna分子压根就不是根据二级结构直接和dna互补的，还需要其他伴侣蛋白参与。不好意思才疏学浅 0 0.人工设计这样的课题我们还没研究过。
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10楼2013-11-06 22:57:06
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kongzhen1985

新虫 (初入文坛)
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10楼: Originally posted by 沙门小rna at 2013-11-06 22:57:06
现在我们组貌似二级结构预测分析都是在网上弄的，mfold等，我们自己木有软件~至于rna的二级结构和互补配对这个问题。真心不懂。我只知道反式作用大都是在颈环结构上配对，而有些rna分子压根就不是根据二级结构直接 ...

没事的，那我在研究研究，对于实验中的一些常规步骤如果不会的话到时候还请您多多指教，谢啦
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11楼2013-11-07 10:16:46
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沙门小rna

金虫 (正式写手)
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11楼: Originally posted by kongzhen1985 at 2013-11-07 10:16:46
没事的，那我在研究研究，对于实验中的一些常规步骤如果不会的话到时候还请您多多指教，谢啦...

额。互相学习~
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12楼2013-11-07 10:24:42
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23SALLY

新虫 (初入文坛)
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小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
请问楼主现在还在做细菌的小RNA吗？可否问你一些问题呢
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13楼2016-01-17 09:43:27
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