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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 妹子急求： 甲基化特异性PCR引物设计
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tianxing1230

金虫 (小有名气)

[求助] 妹子急求： 甲基化特异性PCR引物设计 已有1人参与

我要设计引物，现提供的信息如下：
1. 生物物种：c57bl/6 小鼠
2.实验目的：APP、BACE1 和PS1 作为靶基因，检测其启动子区甲基化状态
3. 实验方法：MSPCR(甲基化特异性PCR)
4.物种基因的序列或者序列号： 在NCBI GENEBANK数据库查询得到，但因为我没有分子生物学基础，我不知道具体的启动子区等信息，请帮帮我，查阅下这几个基因的启动子区，并列出，以便后续设计AD相关基因APP、PS1、BACE1 的甲基化和非甲基化引物， 如您的朋友在引物设计方面很经验，能不能帮我看下，谢谢！期待您回复！
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1楼 2013-10-23 16:10:25
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tianxing1230

金虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by kehan777 at 2013-10-23 20:24:27
请问甲基化岛序列，从哪里得来？...

大侠，启动子区怎么找？我想是不是找到启动子序列，吧序列放在在线软件，就有引物，是吗？请多赐教，谢谢了
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5楼2013-10-27 09:46:27
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David勇

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2013-10-23 16:19:34
http://www.urogene.org/methprimer/
把你要设计引物的甲基化岛序列不经过转换复制进去，自动会帮你设计的。
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2楼2013-10-23 16:17:39
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kehan777

木虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by David勇 at 2013-10-23 16:17:39
http://www.urogene.org/methprimer/
把你要设计引物的甲基化岛序列不经过转换复制进去，自动会帮你设计的。

请问甲基化岛序列，从哪里得来？
赞一下 回复此楼
3楼2013-10-23 20:24:27
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David勇

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by kehan777 at 2013-10-23 20:24:27
请问甲基化岛序列，从哪里得来？...

参考文献，或者将DNA序列输入在我给你的这个网站，自动会出来甲基化岛，还可以帮你设计引物。
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4楼2013-10-23 20:48:09
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