| 查看: 1752 | 回复: 4 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
[求助]
蛋白序列的BLAST
|
|||
| 我现在有一个链霉菌，但目前这个菌的基因组还没有被注释，现在这个菌的所有的可能的蛋白序列已经被预测出来了，现在想从蛋白序列入手同天蓝色链霉菌（模式菌）比对它的蛋白序列，得到我的这个菌中的蛋白信息。想问的是我如何将我的菌的蛋白序列同天蓝色链霉菌的蛋白序列对比，最好是批量对比，了解我的菌中的蛋白有哪些是可以知道功能的（具体是什么功能，催化什么反应），哪些是不知道的？还望各位了解这方面的多多指教~！ |
回复此楼» 猜你喜欢
垃圾破二本职称评审标准
已经有19人回复
-
职称评审没过，求安慰
已经有53人回复
-
毕业后当辅导员了，天天各种学生超烦
已经有5人回复
-
26申博自荐
已经有3人回复
-
A期刊撤稿
已经有4人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- BLAST的使用方法
已经有4人回复
- 通过什么实验可以获得新蛋白的基因序列？
已经有11人回复
- 在NCBI里搜索到a基因多条序列，如何确定该基因的序列？
已经有9人回复
- NCBI上酶蛋白序列含有信号肽吗（原核）
已经有5人回复
- MEGA进行聚类分析中使用的序列是什么序列？怎样获得？
已经有4人回复
- 如何查找一个蛋白DNA结合域的基因序列？
已经有4人回复
- NCBI在线blast的问题
已经有7人回复
- 急求序列结构分析
已经有9人回复
- 请问：NCBI Blast里得出的序列的 e value是什么意思？
已经有7人回复
- 想要设计引物 可是NCBI中blast后只有蛋白序列 如何得到基因序列 谢谢啊
已经有15人回复
- 已知蛋白序列，如何得到对应的基因序列？
已经有5人回复
- 如何对已经进行BLAST比对的序列进行功能预测
已经有4人回复
- PSI-BLAST怎样输出蛋白序列的PSSM打分矩阵
已经有13人回复
- 知道氨基酸序列，如何得知核苷酸序列
已经有5人回复
- NCBI中的BLAST使用
已经有12人回复
- 如何得到已知蛋白序列的对应的基因序列
已经有8人回复
- 蛋白进化树构建的序列选择原则
已经有6人回复
- 蛋白质的氨基酸序列问题
已经有8人回复
- Blast哪里下载？
已经有5人回复
- 【分享】蛋白质结构预测流程
已经有32人回复
- 【求助/交流】请教多个蛋白质序列比对显示保守区域的问题
已经有9人回复
- 【求助】氨基酸序列三维结构的获得
已经有5人回复
【答案】应助回帖
★ ★
感谢参与，应助指数 +1
jmcookie: 金币+1, ★有帮助 2013-10-19 10:33:20
laozuzunzhe: 金币+1, 鼓励应助！ 2013-10-21 08:52:46
感谢参与，应助指数 +1
jmcookie: 金币+1, ★有帮助 2013-10-19 10:33:20
laozuzunzhe: 金币+1, 鼓励应助！ 2013-10-21 08:52:46
| ExPASy是一个专业分析蛋白的网站，由瑞士生物信息研究所（SIB）维护，可对蛋白质序列、结构及2-D电泳数据进行分析。在网站上，依据不同目的，有很多工具可供选择。网址为http://www.expasy.org/。生物信息学课上老师讲的。 |
3楼2013-10-19 09:59:32
qingarmy
金虫 (正式写手)
- 应助: 19 (小学生)
- 金币: 1357.3
- 散金: 222
- 红花: 4
- 帖子: 890
- 在线: 318.8小时
- 虫号: 2612192
- 注册: 2013-08-23
- 专业: 生物信息学
【答案】应助回帖
★
感谢参与，应助指数 +1
jmcookie: 金币+1, ★有帮助, 不知道这个能不能实现批量Blast，我先试试，谢谢你哦 2013-10-19 09:00:13
感谢参与，应助指数 +1
jmcookie: 金币+1, ★有帮助, 不知道这个能不能实现批量Blast，我先试试，谢谢你哦 2013-10-19 09:00:13
| http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Bl ... LAST_INIT=GlobalAln你试试这个，这是NCBI中的一个蛋白比对工具，我不常用这个，希望对你有用 |
2楼2013-10-19 07:29:06
4楼2013-10-20 09:41:45
5楼2013-10-21 08:39:37