24小时热门版块排行榜    

查看: 1922  |  回复: 5

wwdxx2004

金虫 (正式写手)

[求助] 求分枝杆菌基因组的提取方法

求分枝杆菌基因组的提取方法
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

LOVEMeisq

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
wwdxx2004: 金币+1, ★有帮助, 谢谢! 2013-10-04 11:06:16
kx444555: 金币+3, 鼓励交流 2013-10-04 11:07:27
1.灭活的斜面加入2mlTE,取1ml,12 000rpm,5min,弃上清。
2.沉淀物加入565μl的TE缓冲液,吸管反复吹打使之重悬,置于-70℃冰箱中放置过夜。加入5μl蛋白酶K、30μl 10%SDS,混匀,于65℃温育>1h。
3.加入等体积的酚/氯仿/异戊醇(25:24:1),混匀,12000rpm,5min,将上清液转入一只新管中。
4.加入0.6体积冰异丙醇,轻轻混合直到DNA沉淀下来,-20℃静置20min,12000rpm,5min,弃上清。1ml的70%冰乙醇洗涤。
5.12000rpm,5min,弃上清,室温干燥,重溶于40μl的TE缓冲液。
这个是结核分枝杆菌的。
2楼2013-10-04 10:44:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wwdxx2004

金虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by LOVEMeisq at 2013-10-04 10:44:08
1.灭活的斜面加入2mlTE,取1ml,12 000rpm,5min,弃上清。
2.沉淀物加入565μl的TE缓冲液,吸管反复吹打使之重悬,置于-70℃冰箱中放置过夜。加入5μl蛋白酶K、30μl 10%SDS,混匀,于65℃温育>1h。
3.加入等 ...

请问提过分枝杆菌的质粒吗?用普通细菌质粒提取试剂盒可以吗?还有请问要是做菌落PCR与一般细菌一样吗?谢谢!
3楼2013-10-04 11:07:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

LOVEMeisq

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★
wwdxx2004: 金币+1, ★有帮助 2013-10-08 14:31:24
可以用磁珠法试试,我也没做过。应该可以。
菌落PCR是直接把菌通过枪头或其他物品转移到PCR体系中,在94℃变性时,细菌一般会被煮裂解,基因组和质粒直接被释放出来作为模板;
普通PCR用的DNA模板是经提纯后的DNA,例如质粒,cDNA、genome等;
由于蛋白和其它杂质干扰的存在,菌落PCR效果一般比普通PCR效果差。
4楼2013-10-05 12:56:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

文库构建

铁虫 (小有名气)


【答案】应助回帖

细菌基因组DNA的制备
  一、材料
  细菌培养物。
  二、设备
  移液管, 高速冷冻离心机, 台式离心机,水浴锅。
  三、试剂
  1、CTAB/NaCl溶液:4.1g NaCl溶解于80ml H2 O,缓慢加入10g CTAB,加水至100ml。
  2、其它试剂:氯仿:异戊醇(24:1),酚:氯仿:异戊醇(25:24:1),异丙醇,70% 乙醇,TE,10% SDS,蛋白酶 K (20mg/ml或粉剂),5mol/L NaCl。
  四、操作步骤:
  1. 100ml 细菌过夜培养液, 5000rpm离心10分钟, 去上清液。
  2. 加9.5ml TE悬浮沉淀, 并加0.5ml 10% SDS, 50μl 20mg/ml(或1mg干粉)蛋白酶 K, 混匀, 37℃保温1小时。
  3. 加1.5ml 5mol/L NaCl, 混匀。
  4. 加1.5ml CTAB/NaCl溶液, 混匀, 65℃保温20分钟。
  5. 用等体积酚:氯仿:异戊醇(25:24:1)抽提, 5000rpm离心10分钟, 将上清液移至干净离心管。
  6. 用等体积氯仿:异戊醇(24:1)抽提, 取上清液移至干净管中。
  7. 加1倍体积异丙醇, 颠倒混合, 室温下静止10分钟,沉淀DNA。
  8. 用玻棒捞出DNA沉淀, 70%乙醇漂洗后, 吸干,溶解于1ml TE, -20℃保存。如DNA沉淀无法捞出,可5000rpm离心, 使DNA沉淀。
  9. 如要除去其中的RNA, 可以按本章第三节中操作步骤处理。

来自:百博明创(北京)
5楼2013-10-16 09:52:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

971435258

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by LOVEMeisq at 2013-10-04 10:44:08
1.灭活的斜面加入2mlTE,取1ml,12 000rpm,5min,弃上清。
2.沉淀物加入565μl的TE缓冲液,吸管反复吹打使之重悬,置于-70℃冰箱中放置过夜。加入5μl蛋白酶K、30μl 10%SDS,混匀,于65℃温育>1h。
3.加入等 ...

为什么不加溶菌酶和RNase呢,求解
6楼2014-11-16 09:44:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 wwdxx2004 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 BMTdnp4OJO9f 2026-11-06 4/200 2026-11-07 19:36 by Xc2FxHsHkBNc
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 BMTdnp4OJO9f 2026-11-06 4/200 2026-11-07 19:03 by Xc2FxHsHkBNc
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 BMTdnp4OJO9f 2026-11-06 4/200 2026-11-07 18:52 by Xc2FxHsHkBNc
[硕博家园] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 BMTdnp4OJO9f 2026-11-06 5/250 2026-11-07 17:45 by Xc2FxHsHkBNc
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 2rKfVQg2jQww 2026-11-06 5/250 2026-11-07 17:23 by Xc2FxHsHkBNc
[考博] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 5/250 2026-11-07 16:06 by Xc2FxHsHkBNc
[教师之家] 延安大学回应“副教授留绝笔信”:确已离世,正核实举报内容 +3 yexuqing 2026-11-04 5/250 2026-11-07 13:22 by 苏东坡二世
[公派出国] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +8 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 23/1150 2026-11-07 06:49 by Equinoxhua
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-04 10/500 2026-11-06 16:23 by 5sJFDKp2kwuI
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 10/500 2026-11-06 16:12 by 5sJFDKp2kwuI
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +7 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 17/850 2026-11-06 13:47 by BkA9Bi5cMhkD
[公派出国] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +8 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 12/600 2026-11-06 13:47 by BkA9Bi5cMhkD
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-05 10/500 2026-11-06 12:32 by BkA9Bi5cMhkD
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +5 kvewwGtKktqB 2026-11-04 14/700 2026-11-06 05:10 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +6 kvewwGtKktqB 2026-11-04 16/800 2026-11-06 05:00 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 12/600 2026-11-06 04:47 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-04 8/400 2026-11-06 02:24 by qL1cU46YIdK0
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 10/500 2026-11-06 02:04 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 hNpp4Y2CGvSC 2026-11-04 12/600 2026-11-06 01:53 by qL1cU46YIdK0
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +6 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 10/500 2026-11-06 01:51 by qL1cU46YIdK0
信息提示
请填处理意见