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转基因猴子木虫 (正式写手)
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关于Gromacs
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最近想对目标酶做下分子模拟计算下RMSD RMSF SASA等数据，计算下在高温下蛋白质的解折叠路径。 我想问下 1Gromacs 或者Amber 等软件是需要配合VMD使用的还是单独进行计算的？ 2这两个软件可以在win7上使用吗？ 3有没有详细的手把手教的那种资料？ 4各位推荐本书或资料？ 先谢谢各位，希望大家多多指教！ |
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ben_ladeng: 金币+2, 谢谢指教 2013-08-30 21:56:13
转基因猴子: 金币+10, ★★★★★最佳答案 2013-09-02 09:23:27
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1、gromacs 和amber是计算的软件，VMD 是用来显示，分析处理等的软件，计算的时候，都不需要使用VMD ，但是建模的时候和后续处理的时候，可能会用到。 2、我知道gromacs 可以，如果是你想练练手可以，如果做研究使用，估计还是需要linux系统，需要服务器 3、gromacs 的很多啊，看看本版里的置顶资源，搜索几个关键词“GROMACS Introductory Tutorial.pdf” “1OMB.pdb的Gromacs 计算过程总结” 等等 4、官网上的手册 |
2楼2013-08-30 16:10:10
转基因猴子
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