24小时热门版块排行榜    

查看: 1051  |  回复: 5
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

chboit

新虫 (小有名气)

[交流] 求助目的基因全序列查询! 已有4人参与

找了一天也找不到,目的基因是硫酸盐还原菌的脱硫基因dsrB(dissimilatory sulfite reductase),想找到它的全序列来做质粒合成,求帮助啊!!!!!Sample Text
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

力亮

木虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
你应该在genbank 里面输入目的基因!找出来序列,然后进行下步工作
突然间的自我
6楼2013-08-12 19:30:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

huanghznd

金虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
gyesang: 金币+5, good! 2013-08-07 16:00:05
dissimilatory sulfite reductase [uncultured sulfate-reducing bacterium]
GenBank: ABI97365.1
FASTA Graphics
Go to:
LOCUS       ABI97365                 250 aa            linear   ENV 13-NOV-2008
DEFINITION  dissimilatory sulfite reductase, partial [uncultured
            sulfate-reducing bacterium].
ACCESSION   ABI97365
VERSION     ABI97365.1  GI:115432176
DBSOURCE    accession DQ903925.1
KEYWORDS    .
SOURCE      uncultured sulfate-reducing bacterium
  ORGANISM  uncultured sulfate-reducing bacterium
            Bacteria; environmental samples.
REFERENCE   1  (residues 1 to 250)
  AUTHORS   Chi Fru,E. and Athar,R.
  TITLE     In situ bacterial colonization of compacted bentonite under deep
            geological high-level radioactive waste repository conditions
  JOURNAL   Appl. Microbiol. Biotechnol. 79 (3), 499-510 (2008)
   PUBMED   18379777
REFERENCE   2  (residues 1 to 250)
  AUTHORS   Fru,E.C., Atha,R., O'Neill,A.H. and Pedersen,K.
  TITLE     Comparative 16S rRNA and dissimilatory sulfite reductase (DSR) gene
            characterization of sulfate-reducing prokaryotes in a deep granitic
            environment
  JOURNAL   Unpublished
REFERENCE   3  (residues 1 to 250)
  AUTHORS   Fru,E.C., Atha,R., O'Neill,A.H. and Pedersen,K.
  TITLE     Direct Submission
  JOURNAL   Submitted (16-AUG-2006) Cell and Molecular Biology, Microbiology,
            Gothenburg University, Box 462, Gothenburg 405 30, Sweden
COMMENT     Method: conceptual translation.
FEATURES             Location/Qualifiers
     source          1..250
                     /organism="uncultured sulfate-reducing bacterium"
                     /isolation_source="granitic aquifer"
                     /db_xref="taxon:153939"
                     /clone="R4"
                     /environmental_sample
     Protein         <1..>250
                     /product="dissimilatory sulfite reductase"
     Region          1..>250
                     /region_name="dsrA"
                     /note="sulfite reductase, dissimilatory-type alpha
                     subunit; TIGR02064"
                     /db_xref="CDD:211711"
     Region          16..74
                     /region_name="NIR_SIR_ferr"
                     /note="Nitrite/Sulfite reductase ferredoxin-like half
                     domain; pfam03460"
                     /db_xref="CDD:202646"
     CDS             1..250
                     /gene="dsrA"
                     /coded_by="DQ903925.1:<1..>753"
                     /codon_start=3
                     /transl_table=11
ORIGIN      
        1 rfsdvpeqfp aaahfhtirv nqpsgwyytt dalrqlydiw dkygsgltnm hgstgdavfl
       61 gagtdeledi fcelskaewd lggsgsdvrt pscclgpsrc efacydtlal tydltmtyqd
      121 elhrpifpyk wkfkmagcpn dcvasiarsd fsiigtwrdd iridhdavte yaeagldikf
      181 dvarrcptkc ikwdgtklei dnsecvrcmh cinvmpkalr pgtdtgatll igakapivqg
      241 ailssvlvpf
//
Uncultured sulfate-reducing bacterium clone R4 dissimilatory sulfite reductase (dsrA) gene, partial cds
GenBank: DQ903925.1
GenBank Graphics PopSet
>gi|115432175|gb|DQ903925.1| Uncultured sulfate-reducing bacterium clone R4 dissimilatory sulfite reductase (dsrA) gene, partial cds
GCCGGTTCTCGGATGTGCCGGAGCAATTTCCAGCAGCGGCCCATTTCCACACCATCCGTGTCAACCAGCC
ATCAGGCTGGTATTACACCACTGATGCCTTAAGGCAGTTGTATGACATCTGGGACAAGTACGGCTCAGGC
CTGACCAATATGCACGGCTCAACAGGTGATGCCGTATTCTTAGGCGCAGGCACCGATGAGTTAGAAGACA
TCTTCTGCGAGCTTTCCAAAGCAGAATGGGATTTAGGCGGCTCAGGCTCGGATGTGCGCACTCCCAGTTG
CTGCCTTGGTCCGTCCAGATGTGAATTTGCCTGCTACGACACCCTGGCCTTAACCTATGATTTGACCATG
ACCTACCAGGACGAGCTGCACAGACCGATCTTTCCATACAAATGGAAGTTCAAGATGGCTGGCTGTCCAA
ATGACTGCGTGGCCTCGATTGCCCGGTCTGATTTCTCTATCATTGGCACCTGGCGGGATGATATTCGTAT
TGACCACGATGCGGTAACCGAATATGCCGAAGCCGGCCTGGACATCAAGTTTGATGTTGCCCGCAGATGC
CCCACCAAGTGTATCAAATGGGATGGAACCAAGTTAGAGATTGACAACAGTGAGTGTGTCAGATGTATGC
ACTGCATTAATGTCATGCCTAAAGCCCTTCGTCCGGGCACTGACACCGGAGCTACTCTCTTGATTGGAGC
CAAGGCCCCCATTGTCCAGGGTGCAATTCTCTCTTCAGTCTTAGTGCCCTTTA
2楼2013-08-07 13:36:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mmz123250

新虫 (初入文坛)

★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖应助! 2013-08-07 15:59:53
进入NCBI在线,输入dissimilatory sulfite reductase,选GENE。进入后,点相应的GI:标识的序列号,就会找到楼上的的信息。网上有很多查询目的基因序列的信息,多查查。
3楼2013-08-07 14:07:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chboit

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by huanghznd at 2013-08-07 13:36:39
dissimilatory sulfite reductase
GenBank: ABI97365.1
FASTA Graphics
Go to:
LOCUS       ABI97365                 250 aa            linear   ENV 13-NOV-2008
DEFINITION  dissimilatory sulfite redu ...

你好,我想问下你,我想通过已知的引物来找到目的基因可以吗?我把引物输入到primer blast里面但是没有结果出来,你能教教我么?
4楼2013-08-12 11:22:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 308求调剂 +3 墨墨漠 2026-03-21 3/150 2026-03-22 16:54 by i_cooler
[考研] 384求调剂 +3 子系博 2026-03-22 4/200 2026-03-22 11:04 by 搏击518
[考研] 资源与环境 调剂申请(333分) +5 holy J 2026-03-21 5/250 2026-03-21 22:42 by Catalysis25
[考研] 广西大学材料导师推荐 +3 夏夏夏小正 2026-03-17 5/250 2026-03-21 22:20 by 金昊ML
[考研] 0703化学调剂 +4 妮妮ninicgb 2026-03-21 4/200 2026-03-21 18:39 by 学员8dgXkO
[考研] 材料学硕333求调剂 +3 北道巷 2026-03-18 3/150 2026-03-21 18:17 by 学员8dgXkO
[考研] 297求调剂 +11 戏精丹丹丹 2026-03-17 12/600 2026-03-21 17:47 by ColorlessPI
[考研] 303求调剂 +5 睿08 2026-03-17 7/350 2026-03-21 03:11 by JourneyLucky
[考研] 308求调剂 +3 阿姐阿姐家啊 2026-03-18 3/150 2026-03-20 23:24 by JourneyLucky
[考研] 304求调剂 +7 司空. 2026-03-18 7/350 2026-03-20 23:08 by JourneyLucky
[考研] 329求调剂 +9 想上学吖吖 2026-03-19 9/450 2026-03-20 22:01 by luoyongfeng
[考研] 一志愿西南交通 专硕 材料355 本科双非 求调剂 +5 西南交通专材355 2026-03-19 5/250 2026-03-20 21:10 by JourneyLucky
[考研] 材料学求调剂 +4 Stella_Yao 2026-03-20 4/200 2026-03-20 20:28 by ms629
[考研] 广西大学家禽遗传育种课题组2026年硕士招生(接收计算机专业调剂) +3 123阿标 2026-03-17 3/150 2026-03-20 15:58 by 飞行琦
[考研] 一志愿中国海洋大学,生物学,301分,求调剂 +5 1孙悟空 2026-03-17 6/300 2026-03-19 23:46 by zcl123
[考研] 081700化工学硕调剂 +3 【1】 2026-03-16 3/150 2026-03-19 23:40 by edmund7
[考研] 0703化学调剂 +4 18889395102 2026-03-18 4/200 2026-03-19 16:13 by 30660438
[考研] 收复试调剂生 +4 雨后秋荷 2026-03-18 4/200 2026-03-18 14:16 by elevennnne
[考研] 有没有道铁/土木的想调剂南林,给自己招师弟中~ +3 TqlXswl 2026-03-16 7/350 2026-03-17 15:23 by TqlXswl
[考研] 一志愿南京大学,080500材料科学与工程,调剂 +4 Jy? 2026-03-16 4/200 2026-03-17 11:02 by gaoqiong
信息提示
请填处理意见