应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 求助目的基因全序列查询！
61/1返回列表
查看: 1050  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

chboit

新虫 (小有名气)

[交流] 求助目的基因全序列查询！ 已有4人参与

找了一天也找不到，目的基因是硫酸盐还原菌的脱硫基因dsrB（dissimilatory sulfite reductase），想找到它的全序列来做质粒合成，求帮助啊！！！！！Sample Text
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2013-08-06 20:19:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

huanghznd

金虫 (小有名气)
★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
gyesang: 金币+5, good! 2013-08-07 16:00:05
dissimilatory sulfite reductase [uncultured sulfate-reducing bacterium]
GenBank: ABI97365.1
FASTA Graphics
Go to:
LOCUS       ABI97365                 250 aa            linear   ENV 13-NOV-2008
DEFINITION  dissimilatory sulfite reductase, partial [uncultured
            sulfate-reducing bacterium].
ACCESSION   ABI97365
VERSION     ABI97365.1  GI:115432176
DBSOURCE    accession DQ903925.1
KEYWORDS    .
SOURCE      uncultured sulfate-reducing bacterium
  ORGANISM  uncultured sulfate-reducing bacterium
            Bacteria; environmental samples.
REFERENCE   1  (residues 1 to 250)
  AUTHORS   Chi Fru,E. and Athar,R.
  TITLE     In situ bacterial colonization of compacted bentonite under deep
            geological high-level radioactive waste repository conditions
  JOURNAL   Appl. Microbiol. Biotechnol. 79 (3), 499-510 (2008)
   PUBMED   18379777
REFERENCE   2  (residues 1 to 250)
  AUTHORS   Fru,E.C., Atha,R., O'Neill,A.H. and Pedersen,K.
  TITLE     Comparative 16S rRNA and dissimilatory sulfite reductase (DSR) gene
            characterization of sulfate-reducing prokaryotes in a deep granitic
            environment
  JOURNAL   Unpublished
REFERENCE   3  (residues 1 to 250)
  AUTHORS   Fru,E.C., Atha,R., O'Neill,A.H. and Pedersen,K.
  TITLE     Direct Submission
  JOURNAL   Submitted (16-AUG-2006) Cell and Molecular Biology, Microbiology,
            Gothenburg University, Box 462, Gothenburg 405 30, Sweden
COMMENT     Method: conceptual translation.
FEATURES             Location/Qualifiers
     source          1..250
                     /organism="uncultured sulfate-reducing bacterium"
                     /isolation_source="granitic aquifer"
                     /db_xref="taxon:153939"
                     /clone="R4"
                     /environmental_sample
     Protein         <1..>250
                     /product="dissimilatory sulfite reductase"
     Region          1..>250
                     /region_name="dsrA"
                     /note="sulfite reductase, dissimilatory-type alpha
                     subunit; TIGR02064"
                     /db_xref="CDD:211711"
     Region          16..74
                     /region_name="NIR_SIR_ferr"
                     /note="Nitrite/Sulfite reductase ferredoxin-like half
                     domain; pfam03460"
                     /db_xref="CDD:202646"
     CDS             1..250
                     /gene="dsrA"
                     /coded_by="DQ903925.1:<1..>753"
                     /codon_start=3
                     /transl_table=11
ORIGIN      
        1 rfsdvpeqfp aaahfhtirv nqpsgwyytt dalrqlydiw dkygsgltnm hgstgdavfl
       61 gagtdeledi fcelskaewd lggsgsdvrt pscclgpsrc efacydtlal tydltmtyqd
      121 elhrpifpyk wkfkmagcpn dcvasiarsd fsiigtwrdd iridhdavte yaeagldikf
      181 dvarrcptkc ikwdgtklei dnsecvrcmh cinvmpkalr pgtdtgatll igakapivqg
      241 ailssvlvpf
//
Uncultured sulfate-reducing bacterium clone R4 dissimilatory sulfite reductase (dsrA) gene, partial cds
GenBank: DQ903925.1
GenBank Graphics PopSet
>gi|115432175|gb|DQ903925.1| Uncultured sulfate-reducing bacterium clone R4 dissimilatory sulfite reductase (dsrA) gene, partial cds
GCCGGTTCTCGGATGTGCCGGAGCAATTTCCAGCAGCGGCCCATTTCCACACCATCCGTGTCAACCAGCC
ATCAGGCTGGTATTACACCACTGATGCCTTAAGGCAGTTGTATGACATCTGGGACAAGTACGGCTCAGGC
CTGACCAATATGCACGGCTCAACAGGTGATGCCGTATTCTTAGGCGCAGGCACCGATGAGTTAGAAGACA
TCTTCTGCGAGCTTTCCAAAGCAGAATGGGATTTAGGCGGCTCAGGCTCGGATGTGCGCACTCCCAGTTG
CTGCCTTGGTCCGTCCAGATGTGAATTTGCCTGCTACGACACCCTGGCCTTAACCTATGATTTGACCATG
ACCTACCAGGACGAGCTGCACAGACCGATCTTTCCATACAAATGGAAGTTCAAGATGGCTGGCTGTCCAA
ATGACTGCGTGGCCTCGATTGCCCGGTCTGATTTCTCTATCATTGGCACCTGGCGGGATGATATTCGTAT
TGACCACGATGCGGTAACCGAATATGCCGAAGCCGGCCTGGACATCAAGTTTGATGTTGCCCGCAGATGC
CCCACCAAGTGTATCAAATGGGATGGAACCAAGTTAGAGATTGACAACAGTGAGTGTGTCAGATGTATGC
ACTGCATTAATGTCATGCCTAAAGCCCTTCGTCCGGGCACTGACACCGGAGCTACTCTCTTGATTGGAGC
CAAGGCCCCCATTGTCCAGGGTGCAATTCTCTCTTCAGTCTTAGTGCCCTTTA
赞一下 回复此楼
2楼2013-08-07 13:36:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mmz123250

新虫 (初入文坛)
★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖应助！ 2013-08-07 15:59:53
进入NCBI在线，输入dissimilatory sulfite reductase，选GENE。进入后，点相应的GI:标识的序列号，就会找到楼上的的信息。网上有很多查询目的基因序列的信息，多查查。
赞一下(1人) 回复此楼
3楼2013-08-07 14:07:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chboit

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by huanghznd at 2013-08-07 13:36:39
dissimilatory sulfite reductase
GenBank: ABI97365.1
FASTA Graphics
Go to:
LOCUS       ABI97365                 250 aa            linear   ENV 13-NOV-2008
DEFINITION  dissimilatory sulfite redu ...

你好，我想问下你，我想通过已知的引物来找到目的基因可以吗？我把引物输入到primer blast里面但是没有结果出来，你能教教我么？
赞一下 回复此楼
4楼2013-08-12 11:22:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gyesang

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
4楼: Originally posted by chboit at 2013-08-12 11:22:53
你好，我想问下你，我想通过已知的引物来找到目的基因可以吗？我把引物输入到primer blast里面但是没有结果出来，你能教教我么？...

有没有选对物种呢？
赞一下 回复此楼
学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
5楼2013-08-12 17:03:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

力亮

木虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
你应该在genbank 里面输入目的基因！找出来序列，然后进行下步工作
赞一下 回复此楼
突然间的自我
6楼2013-08-12 19:30:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 chboit 的主题更新
61/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 材料与化工085600，总分304，本科有两篇sci参与，求调剂 +4 幸运的酱酱 2026-03-22 5/250 2026-03-22 20:15 by edmund7
[考研] 275求调剂 +6 shansx 2026-03-22 8/400 2026-03-22 15:27 by barlinike
[考研] 生物学调剂 +5 Surekei 2026-03-21 5/250 2026-03-22 14:39 by tcx007
[考研] 269专硕求调剂 +6 金恩贝 2026-03-21 6/300 2026-03-22 14:31 by ColorlessPI
[考研] 291 求调剂 +3 化工2026届毕业� 2026-03-21 3/150 2026-03-22 14:26 by ColorlessPI
[考研] 354求调剂 +7 Tyoumou 2026-03-18 10/500 2026-03-22 11:11 by 人来盛
[考研] 286分人工智能专业请求调剂愿意跨考！ +4 lemonzzn 2026-03-17 8/400 2026-03-21 22:49 by lemonzzn
[考研] 材料学硕301分求调剂 +7 Liyouyumairs 2026-03-21 7/350 2026-03-21 22:31 by peike
[考研] 0703化学调剂 +4 妮妮ninicgb 2026-03-21 4/200 2026-03-21 18:39 by 学员8dgXkO
[考研] 279求调剂 +5 红衣隐官 2026-03-21 5/250 2026-03-21 14:59 by lature00
[考研] 材料学学硕080502 337求调剂-一志愿华中科技大学 +4 顺顺顺mr 2026-03-18 5/250 2026-03-21 10:22 by luoyongfeng
[考研] 070300化学319求调剂 +7 锦鲤0909 2026-03-17 7/350 2026-03-21 03:46 by JourneyLucky
[考研] 二本跨考郑大材料306英一数二 +3 z1z2z3879 2026-03-17 3/150 2026-03-21 02:29 by JourneyLucky
[考研] 材料专硕英一数二306 +7 z1z2z3879 2026-03-18 7/350 2026-03-20 23:48 by JourneyLucky
[考研] 广西大学家禽遗传育种课题组2026年硕士招生（接收计算机专业调剂） +3 123阿标 2026-03-17 3/150 2026-03-20 15:58 by 飞行琦
[考研] 288求调剂，一志愿华南理工大学071005 +5 ioodiiij 2026-03-17 5/250 2026-03-19 18:22 by zcl123
[考研] 286求调剂 +6 lemonzzn 2026-03-16 10/500 2026-03-19 14:31 by lemonzzn
[考研] 一志愿福大288有机化学，求调剂 +3 小木虫200408204 2026-03-18 3/150 2026-03-19 13:31 by houyaoxu
[考研] 328求调剂，英语六级551，有科研经历 +4 生物工程调剂 2026-03-16 12/600 2026-03-19 11:10 by 生物工程调剂
[考研] 333求调剂 +3 文思客 2026-03-16 7/350 2026-03-16 18:21 by 文思客
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭