24小时热门版块排行榜    

查看: 1034  |  回复: 5

chboit

新虫 (小有名气)

[交流] 求助目的基因全序列查询! 已有4人参与

找了一天也找不到,目的基因是硫酸盐还原菌的脱硫基因dsrB(dissimilatory sulfite reductase),想找到它的全序列来做质粒合成,求帮助啊!!!!!Sample Text
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

huanghznd

金虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
gyesang: 金币+5, good! 2013-08-07 16:00:05
dissimilatory sulfite reductase [uncultured sulfate-reducing bacterium]
GenBank: ABI97365.1
FASTA Graphics
Go to:
LOCUS       ABI97365                 250 aa            linear   ENV 13-NOV-2008
DEFINITION  dissimilatory sulfite reductase, partial [uncultured
            sulfate-reducing bacterium].
ACCESSION   ABI97365
VERSION     ABI97365.1  GI:115432176
DBSOURCE    accession DQ903925.1
KEYWORDS    .
SOURCE      uncultured sulfate-reducing bacterium
  ORGANISM  uncultured sulfate-reducing bacterium
            Bacteria; environmental samples.
REFERENCE   1  (residues 1 to 250)
  AUTHORS   Chi Fru,E. and Athar,R.
  TITLE     In situ bacterial colonization of compacted bentonite under deep
            geological high-level radioactive waste repository conditions
  JOURNAL   Appl. Microbiol. Biotechnol. 79 (3), 499-510 (2008)
   PUBMED   18379777
REFERENCE   2  (residues 1 to 250)
  AUTHORS   Fru,E.C., Atha,R., O'Neill,A.H. and Pedersen,K.
  TITLE     Comparative 16S rRNA and dissimilatory sulfite reductase (DSR) gene
            characterization of sulfate-reducing prokaryotes in a deep granitic
            environment
  JOURNAL   Unpublished
REFERENCE   3  (residues 1 to 250)
  AUTHORS   Fru,E.C., Atha,R., O'Neill,A.H. and Pedersen,K.
  TITLE     Direct Submission
  JOURNAL   Submitted (16-AUG-2006) Cell and Molecular Biology, Microbiology,
            Gothenburg University, Box 462, Gothenburg 405 30, Sweden
COMMENT     Method: conceptual translation.
FEATURES             Location/Qualifiers
     source          1..250
                     /organism="uncultured sulfate-reducing bacterium"
                     /isolation_source="granitic aquifer"
                     /db_xref="taxon:153939"
                     /clone="R4"
                     /environmental_sample
     Protein         <1..>250
                     /product="dissimilatory sulfite reductase"
     Region          1..>250
                     /region_name="dsrA"
                     /note="sulfite reductase, dissimilatory-type alpha
                     subunit; TIGR02064"
                     /db_xref="CDD:211711"
     Region          16..74
                     /region_name="NIR_SIR_ferr"
                     /note="Nitrite/Sulfite reductase ferredoxin-like half
                     domain; pfam03460"
                     /db_xref="CDD:202646"
     CDS             1..250
                     /gene="dsrA"
                     /coded_by="DQ903925.1:<1..>753"
                     /codon_start=3
                     /transl_table=11
ORIGIN      
        1 rfsdvpeqfp aaahfhtirv nqpsgwyytt dalrqlydiw dkygsgltnm hgstgdavfl
       61 gagtdeledi fcelskaewd lggsgsdvrt pscclgpsrc efacydtlal tydltmtyqd
      121 elhrpifpyk wkfkmagcpn dcvasiarsd fsiigtwrdd iridhdavte yaeagldikf
      181 dvarrcptkc ikwdgtklei dnsecvrcmh cinvmpkalr pgtdtgatll igakapivqg
      241 ailssvlvpf
//
Uncultured sulfate-reducing bacterium clone R4 dissimilatory sulfite reductase (dsrA) gene, partial cds
GenBank: DQ903925.1
GenBank Graphics PopSet
>gi|115432175|gb|DQ903925.1| Uncultured sulfate-reducing bacterium clone R4 dissimilatory sulfite reductase (dsrA) gene, partial cds
GCCGGTTCTCGGATGTGCCGGAGCAATTTCCAGCAGCGGCCCATTTCCACACCATCCGTGTCAACCAGCC
ATCAGGCTGGTATTACACCACTGATGCCTTAAGGCAGTTGTATGACATCTGGGACAAGTACGGCTCAGGC
CTGACCAATATGCACGGCTCAACAGGTGATGCCGTATTCTTAGGCGCAGGCACCGATGAGTTAGAAGACA
TCTTCTGCGAGCTTTCCAAAGCAGAATGGGATTTAGGCGGCTCAGGCTCGGATGTGCGCACTCCCAGTTG
CTGCCTTGGTCCGTCCAGATGTGAATTTGCCTGCTACGACACCCTGGCCTTAACCTATGATTTGACCATG
ACCTACCAGGACGAGCTGCACAGACCGATCTTTCCATACAAATGGAAGTTCAAGATGGCTGGCTGTCCAA
ATGACTGCGTGGCCTCGATTGCCCGGTCTGATTTCTCTATCATTGGCACCTGGCGGGATGATATTCGTAT
TGACCACGATGCGGTAACCGAATATGCCGAAGCCGGCCTGGACATCAAGTTTGATGTTGCCCGCAGATGC
CCCACCAAGTGTATCAAATGGGATGGAACCAAGTTAGAGATTGACAACAGTGAGTGTGTCAGATGTATGC
ACTGCATTAATGTCATGCCTAAAGCCCTTCGTCCGGGCACTGACACCGGAGCTACTCTCTTGATTGGAGC
CAAGGCCCCCATTGTCCAGGGTGCAATTCTCTCTTCAGTCTTAGTGCCCTTTA
2楼2013-08-07 13:36:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mmz123250

新虫 (初入文坛)

★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖应助! 2013-08-07 15:59:53
进入NCBI在线,输入dissimilatory sulfite reductase,选GENE。进入后,点相应的GI:标识的序列号,就会找到楼上的的信息。网上有很多查询目的基因序列的信息,多查查。
3楼2013-08-07 14:07:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chboit

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by huanghznd at 2013-08-07 13:36:39
dissimilatory sulfite reductase
GenBank: ABI97365.1
FASTA Graphics
Go to:
LOCUS       ABI97365                 250 aa            linear   ENV 13-NOV-2008
DEFINITION  dissimilatory sulfite redu ...

你好,我想问下你,我想通过已知的引物来找到目的基因可以吗?我把引物输入到primer blast里面但是没有结果出来,你能教教我么?
4楼2013-08-12 11:22:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gyesang

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
4楼: Originally posted by chboit at 2013-08-12 11:22:53
你好,我想问下你,我想通过已知的引物来找到目的基因可以吗?我把引物输入到primer blast里面但是没有结果出来,你能教教我么?...

有没有选对物种呢?
学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
5楼2013-08-12 17:03:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

力亮

木虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
你应该在genbank 里面输入目的基因!找出来序列,然后进行下步工作
突然间的自我
6楼2013-08-12 19:30:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 chboit 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 275求调剂 +4 明远求学 2026-03-01 4/200 2026-03-02 12:45 by 无际的草原
[考研] 292求调剂 +7 yhk_819 2026-02-28 7/350 2026-03-02 12:43 by 无际的草原
[基金申请] 成果系统访问量大,请15分钟后再尝试。由此给您造成的不便,敬请谅解。 +5 xhuama 2026-03-02 5/250 2026-03-02 12:34 by stidwellNK
[考研] 281求调剂 +5 2026计算机_诚心 2026-03-01 8/400 2026-03-02 11:05 by 汪!?!
[考研] 0856材料与化工,270求调剂 +8 YXCT 2026-03-01 9/450 2026-03-02 11:01 by 无际的草原
[考研] 一志愿郑大材料学硕298分,求调剂 +6 wsl111 2026-03-01 6/300 2026-03-02 11:00 by ydudjddnd
[考研] 欢迎采矿、地质、岩土、计算机、人工智能等专业的同学报考 +5 pin8023 2026-02-28 7/350 2026-03-02 10:33 by ZY,先生
[考研] 调剂 +3 13853210211 2026-03-02 4/200 2026-03-02 10:16 by 13853210211
[考研] 0857调剂 +4 一ll半 2026-02-28 5/250 2026-03-02 02:33 by 908055542
[考研] 279求调剂 +3 dua1 2026-03-01 4/200 2026-03-02 00:23 by 大脸蛋子
[考研] 材料化工调剂 +12 今夏不夏 2026-03-01 13/650 2026-03-01 23:32 by L135790
[考研] 0805总分292,求调剂 +7 幻想之殇 2026-03-01 7/350 2026-03-01 21:22 by 公瑾逍遥
[考研] 298求调剂 +6 axyz3 2026-02-28 6/300 2026-03-01 19:00 by 18137688336
[考研] 328求调剂 +3 aaadim 2026-03-01 5/250 2026-03-01 17:29 by njzyff
[考研] 307求调剂 +5 wyyyqx 2026-03-01 5/250 2026-03-01 15:21 by Fff-1
[考研] 303求调剂 +4 今夏不夏 2026-03-01 4/200 2026-03-01 14:46 by 嘟嘟小浣熊
[考研] 求调剂 +6 repeatt?t 2026-02-28 6/300 2026-03-01 14:37 by Sakura绘
[考研] 302材料工程求调剂 +4 Doleres 2026-03-01 5/250 2026-03-01 11:52 by liqiongjy
[考研] 调剂 +3 简木ChuFront 2026-02-28 3/150 2026-03-01 11:46 by 王伟要上岸啊
[考研] 304求调剂 +3 52hz~~ 2026-02-28 5/250 2026-03-01 00:00 by 52hz~~
信息提示
请填处理意见