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求助小鼠抗体可变区基因序列提交问题
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前段时间克隆了几个小鼠抗体可变区的基因序列,并且上传到NCBI,最近收到来信说其中一个序列可能存在移码,让我确认序列是否正确。如果正确,让我提供相应证据证明。我确定自己上传的序列是正确的测序结果,不知该如何提供证据,请有相关经验人士帮忙指导一下。信件原文如下: We are currently processing your GenBank records JN109176-JN109189 and have come across an issue that requires your attention. Upon doing a BLAST similarity search of your sequences, we noticed that there may be a reading frame shift in the following translation relative to similar proteins: JN109185 around nuc 287-288 If the nucleotide sequence is incorrect, send us the corrected sequence, and we will replace the current sequence in your submission. If the sequence is correct, please let us know if you have any evidence that this frame shifted protein is translated. |
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2楼2011-11-01 09:21:50
gongeleven
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3楼2011-11-01 09:42:54
| atttccagcttggtccccgagccgaacgtgaaacacagtgctgacagaaatacattgcaatatcatcctcctccacaggatggatgttgaggctgaagtctgtcccagacccactgccactaaacctggcagggaccccagattctacgttggatgcagcatagatgaggagtttgggtggctgtcctggtttctgttggtaccactgcattaaacttgtgccataatattcaacactttcactggctctgcaggagatggtggctctctgccctagagacacagccaaagaagctggagactggg |
4楼2011-11-01 11:09:15
llyman
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5楼2012-06-07 21:11:54
suifeng91
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