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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 存档旧帖 » 求助小鼠抗体可变区基因序列提交问题
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螺旋技术

新虫 (正式写手)

[求助] 求助小鼠抗体可变区基因序列提交问题

前段时间克隆了几个小鼠抗体可变区的基因序列，并且上传到NCBI，最近收到来信说其中一个序列可能存在移码，让我确认序列是否正确。如果正确，让我提供相应证据证明。我确定自己上传的序列是正确的测序结果，不知该如何提供证据，请有相关经验人士帮忙指导一下。信件原文如下：
We are currently processing your GenBank records JN109176-JN109189
and have come across an issue that requires your attention.

Upon doing a BLAST similarity search of your sequences, we noticed
that there may be a reading frame shift in the following translation
relative to similar proteins:

JN109185 around nuc 287-288

If the nucleotide sequence is incorrect, send us the corrected
sequence, and we will replace the current sequence in your
submission.

If the sequence is correct, please let us know if you have any
evidence that this frame shifted protein is translated.
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1楼 2011-11-01 09:20:19
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Jeverl
2楼2011-11-01 09:21:50
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gongeleven

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

序列发出来看看……………………
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3楼2011-11-01 09:42:54
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螺旋技术

新虫 (正式写手)
atttccagcttggtccccgagccgaacgtgaaacacagtgctgacagaaatacattgcaatatcatcctcctccacaggatggatgttgaggctgaagtctgtcccagacccactgccactaaacctggcagggaccccagattctacgttggatgcagcatagatgaggagtttgggtggctgtcctggtttctgttggtaccactgcattaaacttgtgccataatattcaacactttcactggctctgcaggagatggtggctctctgccctagagacacagccaaagaagctggagactggg
赞一下 回复此楼
4楼2011-11-01 11:09:15
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llyman

银虫 (小有名气)
请教一下：现有某商业泛素单抗，如何获得该抗体的基因序列？谢谢
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5楼2012-06-07 21:11:54
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suifeng91

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
小丹木木: 金币+5, MolEPI+1, 热心的虫虫 2012-06-11 11:22:33
从所给序列分析，是不完整但正常小鼠抗体可变区基因，不完整可能是你所用的引物造成的。分析见附图。
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人生不是一场物质的盛宴，而是一次灵魂的修炼，使它在谢幕之时比开幕之初更为高尚。
6楼2012-06-11 11:18:20
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匿名

用户注销 (正式写手)
本帖仅楼主可见
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7楼2014-02-08 18:13:20
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