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wujunjames

金虫 (小有名气)

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[交流] 关于分子辅助育种问题，求指教

on basis of NGS , how to conceive an effective strategy for molecular breeding in trees
1. Cost VS massive samples
2. Phenotype observation
3. Association model
关于这么个问题，求高手指点下，可以从哪些方面去阐述，有什么样一些思路，或者有没有好的文章可以参考的，谢谢了

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1楼2013-07-04 19:42:38

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bioysy

铜虫 (小有名气)

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★ ★ ★ ★ ★
wujunjames(金币+1): 谢谢参与
wujunjames: 金币+4, 回答言简意赅很有帮助 2013-07-11 21:35:19

NGS本身解决的是基因型鉴定的问题。分子标记辅助育种的意思是：利用基于基因型的选择来替代基于表型的选择。之所以能够用基因型来替代表型，是因为能够确定基因型和表型间的关系。所以一种有效的分子育种策略考虑的重点是：怎样有效的确定基因型和表型间的关联的问题。这个问题的解决办法有两种思路：
一通过作图的方法建立基因型和表型间的关系，包括连锁作图和关联作图
二进行全基因组分子标记辅助选择，也即这篇文章Yunbi Xu et al., Whole-genome strategies for marker-assisted plant breeding. Molecular breeding. 2012提到的策略。这种策略，实质是建立全基因组的标记数据和特定的育种值间的关系，由于具体模型的不同，这里面可能会衍生出n多种方法。这也是一个目前正在研究的领域