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wujunjames

金虫 (小有名气)

[交流] 关于分子辅助育种问题，求指教

on basis of NGS , how to conceive an effective strategy for molecular breeding in trees
1.        Cost VS massive samples
2.        Phenotype observation
3.        Association model
关于这么个问题，求高手指点下，可以从哪些方面去阐述，有什么样一些思路，或者有没有好的文章可以参考的，谢谢了
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1楼 2013-07-04 19:42:38
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

bioysy

铜虫 (小有名气)
★ ★ ★ ★ ★
wujunjames(金币+1): 谢谢参与
wujunjames: 金币+4, 回答言简意赅 很有帮助 2013-07-11 21:35:19
NGS本身解决的是基因型鉴定的问题。分子标记辅助育种的意思是：利用基于基因型的选择来替代基于表型的选择。之所以能够用基因型来替代表型，是因为能够确定基因型和表型间的关系。所以一种有效的分子育种策略考虑的重点是：怎样有效的确定基因型和表型间的关联的问题。这个问题的解决办法有两种思路：
一 通过作图的方法建立基因型和表型间的关系，包括连锁作图和关联作图
二 进行全基因组分子标记辅助选择，也即这篇文章Yunbi Xu et al., Whole-genome strategies for marker-assisted plant breeding. Molecular breeding. 2012提到的策略。这种策略，实质是建立全基因组的标记数据和特定的育种值间的关系，由于具体模型的不同，这里面可能会衍生出n多种方法。这也是一个目前正在研究的领域
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20楼2013-07-08 23:18:12
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假大空

木虫之王 (文学泰斗)
★
wujunjames(金币+1): 谢谢参与
??
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3楼2013-07-04 20:04:06
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wendy3

金虫 (文坛精英)
★
wujunjames(金币+1): 谢谢参与
愿楼主心想事成
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5楼2013-07-04 20:17:59
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fakebook

木虫 (文坛精英)
★
wujunjames(金币+1): 谢谢参与
Good luck
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6楼2013-07-04 20:18:15
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b729

金虫 (文坛精英)
★
wujunjames(金币+1): 谢谢参与
Good luck
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7楼2013-07-04 20:20:16
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muchfan

木虫 (知名作家)
★
wujunjames(金币+1): 谢谢参与
Best wishes
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8楼2013-07-04 20:22:19
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wujunjames

金虫 (小有名气)
引用回帖:
11楼: Originally posted by 化学多面体 at 2013-07-04 20:59:22

  楼上诸位，能给点有意义的信息吗，拿人金币，与人方便啊
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13楼2013-07-04 21:03:18
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nwsuafliu

木虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★
wujunjames(金币+1): 谢谢参与
wujunjames: 金币+5, with great help 2013-07-11 21:35:48
Please read the papers as follows,
New Phytol. 2012 Feb;193(3):617-24. doi: 10.1111/j.1469-8137.2011.03895.x. Epub 2011 Oct 5.
Accelerating the domestication of trees using genomic selection: accuracy of prediction models across ages and environments


Tree Genetics & Genomes
April 2011, Volume 7, Issue 2, pp 241-255
Genomic selection in forest tree breeding

Genomic prediction in CIMMYT maize and wheat breeding programs 2013
http://www.nature.com/hdy/journa ... ull/hdy201316a.html

and

Yunbi Xu et al., Whole-genome strategies for marker-assisted plant breeding. Molecular breeding. 2012
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18楼2013-07-06 12:20:14
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wujunjames

金虫 (小有名气)
引用回帖:
18楼: Originally posted by nwsuafliu at 2013-07-06 12:20:14
Please read the papers as follows,
New Phytol. 2012 Feb;193(3):617-24. doi: 10.1111/j.1469-8137.2011.03895.x. Epub 2011 Oct 5.
Accelerating the domestication of trees using genomic selection: accur ...

Thanks a lot
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19楼2013-07-08 09:58:57
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lastpython

木虫 (职业作家)
★
wujunjames(金币+1): 谢谢参与
Best wishes
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22楼2013-07-09 00:20:12
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herome

金虫 (知名作家)
★
wujunjames(金币+1): 谢谢参与
愿楼主心想事成
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23楼2013-07-09 04:21:13
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checkin

银虫 (知名作家)
★
wujunjames(金币+1): 谢谢参与
深深祝福
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24楼2013-07-09 04:22:14
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heibi

金虫 (文坛精英)
★
wujunjames(金币+1): 谢谢参与
Best wishes
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25楼2013-07-09 04:23:16
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花开半夏72楼
2013-07-04 19:52   回复  
wujunjames(金币+1): 谢谢参与
沧__海4楼
2013-07-04 20:17   回复  
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readytogo9楼
2013-07-04 20:22   回复  
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mozhean10楼
2013-07-04 20:26   回复  
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化学多面体11楼
2013-07-04 20:59   回复  
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lefantian12212楼
2013-07-04 21:02   回复  
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flyxu14楼
2013-07-04 21:20   回复  
wujunjames(金币+1): 谢谢参与
syhorchid15楼
2013-07-04 21:34   回复  
wujunjames(金币+1): 谢谢参与
祝福
yingying158816楼
2013-07-04 21:43   回复  
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guli201317楼
2013-07-04 21:51   回复  
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readytogo21楼
2013-07-09 00:06   回复  
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