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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » 晶体解析 » 晶体解析的问题求指教
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sirius8528

木虫 (正式写手)

[求助] 晶体解析的问题求指教

手头上有两个已解好的晶体，check后发现有一个马马虎虎，有一个错误挺多，老板让我自己修一下，我完全不懂这方面的知识。有没有好心人指点一下，有什么易上手的方法，感激不尽！
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1楼 2012-07-03 15:14:26
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zx53376876

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
linhua0402313: 金币+1, 欢迎回帖交流，建议很好 2012-07-04 07:40:43
sirius8528: 金币+1, ★有帮助 2012-07-04 10:49:32
你问题问的一点都不明确，你至少也应该把check的结果发上来，才知道怎么处理
马马虎虎是什么概念？好像checkcif的时候没有这个错误。呵呵
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http://www.othello.cn/bbs/attachments/forumid_9/JY9e_1.gif
2楼2012-07-03 20:37:34
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78494428

金虫 (小有名气)
弱弱的问下  晶体是怎么check的？
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3楼2012-07-04 07:26:09
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sirius8528

木虫 (正式写手)
Alert level A
SHFSU01_ALERT_2_A  The absolute value of parameter shift to su ratio > 0.20
            Absolute value of the parameter shift to su ratio given   1.238
            Additional refinement cycles may be required.
PLAT043_ALERT_1_A Check Reported Molecular Weight ................     142.02      
PLAT051_ALERT_1_A Mu(calc) and Mu(CIF) Ratio Differs from 1.0 by .      58.77 Perc.
PLAT053_ALERT_1_A Minimum Crystal Dimension Missing (or Error) ...          ?
PLAT054_ALERT_1_A Medium  Crystal Dimension Missing (or Error) ...          ?
PLAT055_ALERT_1_A Maximum Crystal Dimension Missing (or Error) ...          ?
PLAT080_ALERT_2_A Maximum Shift/Error ............................       1.24      
PLAT122_ALERT_1_A No _symmetry_space_group_name_H-M Given ........          ?
PLAT306_ALERT_2_A Isolated Oxygen Atom (H-atoms Missing ?) .......         O3
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4楼2012-07-04 10:46:30
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sirius8528

木虫 (正式写手)
Alert level B
PLAT052_ALERT_1_B Info on Absorption Correction Method Missing ...          ?
Alert level C
PLAT041_ALERT_1_C Calc. and Reported SumFormula    Strings  Differ          ?
PLAT045_ALERT_1_C Calculated and Reported Z Differ by ............       0.40 Ratio
PLAT068_ALERT_1_C Reported F000 Differs from Calcd (or Missing)...          ?
PLAT166_ALERT_4_C S.U's Given on Coordinates for calc-flagged ....         H7     
PLAT324_ALERT_2_C Check for Possibly Missing H on Coordinating....         N2     
PLAT341_ALERT_3_C Low Bond Precision on  C-C Bonds ...............     0.0093 Ang
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5楼2012-07-04 10:48:18
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sirius8528

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by zx53376876 at 2012-07-03 20:37:34
你问题问的一点都不明确，你至少也应该把check的结果发上来，才知道怎么处理
马马虎虎是什么概念？好像checkcif的时候没有这个错误。呵呵

A类错误在3楼，B、C类错误在4楼，请帮忙看下，多谢！
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6楼2012-07-04 10:49:23
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zhaoruili

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
sirius8528: 金币+5, ★★★很有帮助 2012-07-05 17:20:14
你这没什么问题，A类错误主要是确定单晶大小的，用size命令即可，size a b c（abc代表你晶体的长宽高，一般小于0.3的数据），还有一个是分子量的问题，这个你在.lst文件可以找到，再有一个就是O原子加氢，最后精修的时候多修几轮就可以了。
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路是自己一步一步走出来的，到底能走到哪里，那还得看你自己。
7楼2012-07-04 11:33:35
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zx53376876

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
sirius8528: 金币+10, ★★★很有帮助, 多谢了，有什么软件推荐吗？最好要易上手的我是个门外汉。 2012-07-05 17:23:27
引用回帖:
4楼: Originally posted by sirius8528 at 2012-07-04 10:46:30
Alert level A
SHFSU01_ALERT_2_A  The absolute value of parameter shift to su ratio > 0.20
            Absolute value of the parameter shift to su ratio given   1.238
            Additional refi ...

SHFSU01_ALERT_2_A  The absolute value of parameter shift to su ratio > 0.20
            Absolute value of the parameter shift to su ratio given   1.238
            Additional refinement cycles may be required.
PLAT080_ALERT_2_A Maximum Shift/Error ............................       1.24

多算几轮
=========================================
PLAT043_ALERT_1_A Check Reported Molecular Weight ................     142.02      
PLAT051_ALERT_1_A Mu(calc) and Mu(CIF) Ratio Differs from 1.0 by .      58.77 Perc.


分子式按照check的结果改
=============================================

PLAT053_ALERT_1_A Minimum Crystal Dimension Missing (or Error) ...          ?
PLAT054_ALERT_1_A Medium  Crystal Dimension Missing (or Error) ...          ?
PLAT055_ALERT_1_A Maximum Crystal Dimension Missing (or Error) ...          ?
添上晶体尺寸
==============================
PLAT122_ALERT_1_A No _symmetry_space_group_name_H-M Given ........          ?

空间群 和晶系
======================================
PLAT306_ALERT_2_A Isolated Oxygen Atom (H-atoms Missing ?) .......         O3

O3上加H
===============================
基本上都是小问题。
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8楼2012-07-04 20:11:12
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zx53376876

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

shelxtl 和wingx 都行，只要有人教你，就很快，如果是自己学就有点难。
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9楼2012-07-05 22:26:08
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sirius8528

木虫 (正式写手)
引用回帖:
9楼: Originally posted by zx53376876 at 2012-07-05 22:26:08
shelxtl 和wingx 都行，只要有人教你，就很快，如果是自己学就有点难。

就是没人教啊！
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10楼2012-07-06 14:26:43
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