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鑫焱

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助】紧急!求助ABCG类单晶错误!特别着急等着发文章毕业~多谢各位高手指教~

Alert level A
PLAT093_ALERT_1_A No su's on H-atoms, but refinement reported as .      mixed     
-------------------------------------------------------------------------------
-Alert level B
PLAT230_ALERT_2_B Hirshfeld Test Diff for    C13    --  C14     ..       8.12 su   
PLAT242_ALERT_2_B Check Low       Ueq as Compared to Neighbors for         C4     
--------------------------------------------------------------------------------
Alert level C
PLAT242_ALERT_2_C Check Low       Ueq as Compared to Neighbors for        C21     
--------------------------------------------------------------------------------
Alert level G
REFLT03_ALERT_4_G Please check that the estimate of the number of Friedel pairs is
            correct. If it is not, please give the correct count in the
            _publ_section_exptl_refinement section of the submitted CIF.
           From the CIF: _diffrn_reflns_theta_max           25.03
           From the CIF: _reflns_number_total               4137
           Count of symmetry unique reflns         2289
           Completeness (_total/calc)            180.73%
           TEST3: Check Friedels for noncentro structure
           Estimate of Friedel pairs measured      1848
           Fraction of Friedel pairs measured     0.807
           Are heavy atom types Z>Si present        yes
PLAT371_ALERT_2_G Long   C(sp2)-C(sp1) Bond  C13    -   C14    ...       1.44 Ang.
PLAT710_ALERT_4_G Delete 1-2-3 or 2-3-4 Linear Torsion Angle ... #         37     
            C6  -C13 -C14 -N3     18.00  0.00   1.555   1.555   1.555   1.555  
PLAT710_ALERT_4_G Delete 1-2-3 or 2-3-4 Linear Torsion Angle ... #         38     
            C15 -C13 -C14 -N3      2.00  4.00   1.555   1.555   1.555   1.555

[ Last edited by 鑫焱 on 2010-9-8 at 14:43 ]
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nash603

至尊木虫 (文坛精英)

飘落的碎冰

优秀版主


鑫焱(金币+1):5 2010-09-14 09:17:48
wsht212(金币+1):谢谢交流,希望常来! 2010-09-14 22:18:42
A类错误把mixed改为?
_atom_sites_solution_hydrogens  ?
因为有梦想,我们披星戴月,只争朝夕,因为有承诺,我们义无反顾,勇往直前!
2楼2010-09-08 15:15:13
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jiangqibai

木虫 (正式写手)

注意:A类错误把Cif中的mixed改为constr


nash603(金币+1):谢谢回贴交流! 2010-09-09 08:30:59
鑫焱(金币+1):5 2010-09-14 09:18:05
鑫焱(金币+1):5 2010-09-14 09:19:50
b类错误解决方法:delu 0.001 c13 c14
isor 0.001 c4
c类错误isor 0.001 c21
G类没必要管
3楼2010-09-08 15:57:56
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huahua1216

至尊木虫 (文坛精英)


鑫焱(金币+1):5 2010-09-14 09:18:44
wsht212(金币+1):谢谢交流,希望常来! 2010-09-14 22:19:04
误把mixed改为constr
本文来自: 小木虫论坛 http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2377856&fpage=1
4楼2010-09-08 16:07:33
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鑫焱

铜虫 (小有名气)

多谢高手!A类已解决!B类C类不会改~~~

帝夫:感谢回帖交流! 2010-09-14 14:30:40
引用回帖:
Originally posted by jiangqibai at 2010-09-08 15:57:56:
b类错误解决方法:delu 0.001 c13 c14
isor 0.001 c4
c类错误isor 0.001 c21
G类没必要管

A类错误已经解决了!谢谢你哦!不好意思,还要麻烦你,我刚刚开始接触单晶,不太明白B类和C类错误的修改方法,可以告诉我具体的操作步骤么?在哪个文件夹中?修改哪个位置?
5楼2010-09-14 09:56:21
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文言文

铁杆木虫 (著名写手)


nash603(金币+1):谢谢回贴交流! 2010-09-14 12:30:11
鑫焱(金币+10): 2010-09-14 14:05:56
给你解释一下,其实这些你在check cif的时候注意看英文就知道是什么原因了!
1.PLAT230_ALERT_2_B Hirshfeld Test Diff for    C13    --  C14     ..       8.12 su
  
Hirshfeld 刚性键检查。相近化学特征的原子应具有相同程度的各项异性参数,无序或过度精修都可能会导致大小不一。院子的错误判断也会有这样的结果。DELREF技术(e.g. DIFABS,SHELXA,XABS2)校正的数据通常对含中原子的键有较大的DELU值。
解决方法:
delu 0.02 0.01 * *
2.PLAT242_ALERT_2_B Check Low       Ueq as Compared to Neighbors for         C4     
检测相对于相邻原子过高或过低的U(eq)值。原子的U(eq)值会被拿去与所有的非氢原子的平均U(eq)去比较,如果值太大,可能是原子定错了。
解决方法:
simu 0.01 0.02 3.8 C4  ***(*代表和C4相连的原子)
6楼2010-09-14 10:46:48
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鑫焱

铜虫 (小有名气)

谢谢你哦!

帝夫:感谢回帖交流! 2010-09-14 14:30:36
引用回帖:
Originally posted by 鑫焱 at 2010-09-14 09:56:21:


A类错误已经解决了!谢谢你哦!不好意思,还要麻烦你,我刚刚开始接触单晶,不太明白B类和C类错误的修改方法,可以告诉我具体的操作步骤么?在哪个文件夹中?修改哪个位置?

谢谢你哦!
7楼2010-09-14 14:08:00
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文言文

铁杆木虫 (著名写手)

帝夫:感谢回帖交流! 2010-09-14 14:30:32
引用回帖:
Originally posted by 鑫焱 at 2010-09-14 14:08:00:


谢谢你哦!

在ins文件中加这些命令,并经修就可以了。
8楼2010-09-14 14:25:45
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鑫焱

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by 文言文 at 2010-09-14 14:25:45:

在ins文件中加这些命令,并经修就可以了。

恩,我试试,谢谢
9楼2010-09-14 18:50:14
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