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鑫焱

铜虫 (小有名气)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 228.5
散金: 14
帖子: 57
在线: 21.7小时
虫号: 566634
注册: 2008-05-31
专业: 有机合成

[交流] 【求助】紧急！求助ABCG类单晶错误！特别着急等着发文章毕业~多谢各位高手指教~

Alert level A
PLAT093_ALERT_1_A No su's on H-atoms, but refinement reported as .    mixed
-------------------------------------------------------------------------------
-Alert level B
PLAT230_ALERT_2_B Hirshfeld Test Diff for C13 --  C14    ..    8.12 su
PLAT242_ALERT_2_B Check Low    Ueq as Compared to Neighbors for       C4
--------------------------------------------------------------------------------
Alert level C
PLAT242_ALERT_2_C Check Low    Ueq as Compared to Neighbors for       C21
--------------------------------------------------------------------------------
Alert level G
REFLT03_ALERT_4_G Please check that the estimate of the number of Friedel pairs is
         correct. If it is not, please give the correct count in the
         _publ_section_exptl_refinement section of the submitted CIF.
         From the CIF: _diffrn_reflns_theta_max          25.03
         From the CIF: _reflns_number_total             4137
         Count of symmetry unique reflns       2289
         Completeness (_total/calc)          180.73%
         TEST3: Check Friedels for noncentro structure
         Estimate of Friedel pairs measured    1848
         Fraction of Friedel pairs measured    0.807
         Are heavy atom types Z>Si present       yes
PLAT371_ALERT_2_G Long C(sp2)-C(sp1) Bond  C13 - C14 ...    1.44 Ang.
PLAT710_ALERT_4_G Delete 1-2-3 or 2-3-4 Linear Torsion Angle ... #       37
         C6  -C13 -C14 -N3    18.00  0.00 1.555 1.555 1.555 1.555
PLAT710_ALERT_4_G Delete 1-2-3 or 2-3-4 Linear Torsion Angle ... #       38
         C15 -C13 -C14 -N3    2.00  4.00 1.555 1.555 1.555 1.555

[ Last edited by 鑫焱 on 2010-9-8 at 14:43 ]

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1楼2010-09-08 14:31:52

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文言文

铁杆木虫 (著名写手)

应助: 134 (高中生)
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帖子: 1424
在线: 571.7小时
虫号: 652093
注册: 2008-11-11
专业: 配位化学

★
nash603(金币+1):谢谢回贴交流！ 2010-09-14 12:30:11
鑫焱(金币+10): 2010-09-14 14:05:56

给你解释一下，其实这些你在check cif的时候注意看英文就知道是什么原因了！
1.PLAT230_ALERT_2_B Hirshfeld Test Diff for C13 --  C14    ..    8.12 su

Hirshfeld 刚性键检查。相近化学特征的原子应具有相同程度的各项异性参数，无序或过度精修都可能会导致大小不一。院子的错误判断也会有这样的结果。DELREF技术（e.g. DIFABS，SHELXA，XABS2）校正的数据通常对含中原子的键有较大的DELU值。
解决方法：
delu 0.02 0.01 * *
2.PLAT242_ALERT_2_B Check Low    Ueq as Compared to Neighbors for       C4
检测相对于相邻原子过高或过低的U（eq）值。原子的U（eq）值会被拿去与所有的非氢原子的平均U（eq）去比较，如果值太大，可能是原子定错了。
解决方法：
simu 0.01 0.02 3.8 C4  ***（*代表和C4相连的原子）