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likang198802

银虫 (小有名气)

[求助] MS Amorphous cell 封装聚合物链 有些问题求助 已有1人参与

最近在封装聚合物链,出现两个问题,请大家指教:
1、用具有15个单体的链封装,本身机器的CPU并没有用到多少,这个是软件本身的问题吗,还是我需要怎么设置一下
2、等待很长时间之后,出来的显示失败,no successful configurations after ring spearing check,这个不知道怎么解决,我目前的想法是可能软件本身封装就有成功或者失败,可能这一次不成功,下次就可以成功,不知对不对
请大家多多指教,谢谢了!
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pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ...
感谢参与,应助指数 +1
likang198802: 金币+50, ★★★★★最佳答案 2014-04-09 14:48:33
月只蓝: 金币+5, 感谢指导! 2014-04-10 18:49:15
不知道你的聚合物链是什么

先试试这个看
task——construction
所有quality——coarse
density——0.5-0.8
options——取消optimize geometry——more——取消optimize cell
forcefield选择dreiding、pcff、或者universal

还是不行的话把结构发出来吧
#有问题发论坛,不接受私聊#爱晶体,爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
2楼2014-04-09 09:26:33
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pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪

引用回帖:
4楼: Originally posted by likang198802 at 2014-04-09 14:50:31
谢谢您的帮助,应该是我把几何优化也加上的问题,呵呵,昨天自己也发现这个问题了,不过还是谢谢您的指点...

居然蒙对了~~
几何优化的话有更好的forcite或者discover用,amorphous自带的我感觉没什么必要
#有问题发论坛,不接受私聊#爱晶体,爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
5楼2014-04-09 14:54:50
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普通回帖

pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪

最好把包含error信息的txt文件也发上来
#有问题发论坛,不接受私聊#爱晶体,爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
3楼2014-04-09 09:30:25
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likang198802

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by pigrass at 2014-04-09 09:26:33
不知道你的聚合物链是什么

先试试这个看
task——construction
所有quality——coarse
density——0.5-0.8
options——取消optimize geometry——more——取消optimize cell
forcefield选择dreiding、pcff、 ...

谢谢您的帮助,应该是我把几何优化也加上的问题,呵呵,昨天自己也发现这个问题了,不过还是谢谢您的指点
4楼2014-04-09 14:50:31
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likang198802

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by pigrass at 2014-04-09 09:26:33
不知道你的聚合物链是什么

先试试这个看
task——construction
所有quality——coarse
density——0.5-0.8
options——取消optimize geometry——more——取消optimize cell
forcefield选择dreiding、pcff、 ...

现在又出现了两个封装的问题,
1、有的是没有原因的就失败了,看结果文件最后是“Discover terminated by signal: software termination signal”,
2、有的点封装任务开始之后,没有多长时间就显示失败,弹出的log显示的两个error和一个warn:error: result file(.....里面的是文件路径) does not exit, 然后是error:files not removed from server due to previous errors,在然后是warn: As instructed,files have been left on remote server,these may need to be manually archived.
第一个问题我看了一下没有成功的封装文件,和需要的是参数差五倍的关系,比如说预定的30A,未成功的文件是150A,有些奇怪
求指教啊
6楼2014-04-09 15:09:50
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likang198802

银虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by pigrass at 2014-04-09 14:54:50
居然蒙对了~~
几何优化的话有更好的forcite或者discover用,amorphous自带的我感觉没什么必要...

也不知道我想的对不对,我觉得封装的时候把几何优化选上,封装的同时又优化,肯定花很长的时间,如果成功的话,就不必再几何优化了
7楼2014-04-09 15:13:45
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pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪


月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2014-04-10 18:49:30
引用回帖:
6楼: Originally posted by likang198802 at 2014-04-09 15:09:50
现在又出现了两个封装的问题,
1、有的是没有原因的就失败了,看结果文件最后是“Discover terminated by signal: software termination signal”,
2、有的点封装任务开始之后,没有多长时间就显示失败,弹出的l ...

能不能把
结构

需要达到的要求【密度、大致晶胞长】
发一下


无定型晶胞一般定了大致密度之后不会有大问题的【我故意缺个H居然也能建模成功】
特殊的高密度聚合物可能需要forcite设定压力、温度才能达到
#有问题发论坛,不接受私聊#爱晶体,爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
8楼2014-04-09 15:34:07
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likang198802

银虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by pigrass at 2014-04-09 15:34:07
能不能把
结构

需要达到的要求【密度、大致晶胞长】
发一下


无定型晶胞一般定了大致密度之后不会有大问题的【我故意缺个H居然也能建模成功】
特殊的高密度聚合物可能需要forcite设定压力、温度才能达 ...

现在在尝试做的是聚酰亚胺(PI),一条链上有十个单体,封装成密度为1.36,封装晶胞最大为60A,
MS Amorphous cell 封装聚合物链 有些问题求助
无标题.jpg

9楼2014-04-09 16:04:40
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likang198802

银虫 (小有名气)

我这个密度也不算大的
10楼2014-04-09 16:05:13
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