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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 帮我看看我的PCR那可能出了状况~
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huanyi

金虫 (小有名气)

[求助] 帮我看看我的PCR那可能出了状况~

大家好~本人初次接触微生物，老师要求做个菌群分析~
用的引物是古菌的109和518，这个PCR出来为什么这么模糊，背景也很白~我到目前为止不会看图，只是与别人的比觉得不好，没有达到目标效果。。大家能不能分析下？（没有mark，四个都是模板）
帮我看看我的PCR那可能出了状况~
第一次PCR.JPG
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专注于最重要的那件事，但也不要拒绝其他的
1楼 2013-06-18 22:51:16
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huanyi

金虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by 武穆大成 at 2013-06-19 09:09:22
二聚体主要是引物设计时候出现的问题。。可以选用一些引物设计软件对引物分析，减少二聚体的形成。。当然如果哦引物上无从下手，可以通过热处理来消除引物二聚体。

这点引物二聚体会影响下一步的DGGE吗？
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专注于最重要的那件事，但也不要拒绝其他的
9楼2013-06-19 11:57:12
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bullfrog325

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
1949stone: 金币+1, 严重同意 2013-06-19 07:05:27
我觉得挺好的啊, PCR的产物比较少所以曝光时间长了点造成图片的背景较强. 不过marker下次一定要带.
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2楼2013-06-18 23:23:23
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武穆大成

木虫 (著名写手)

笨蛋

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
1949stone: 金币+1, 严重同意 2013-06-19 07:05:45
有引物二聚体，可以优化下减少二聚体，同时点mark ，确认大小
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3楼2013-06-18 23:43:24
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huanyi

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by bullfrog325 at 2013-06-18 23:23:23
我觉得挺好的啊, PCR的产物比较少所以曝光时间长了点造成图片的背景较强. 不过marker下次一定要带.

这样可以吗？第一次做，老师又不懂，自己的分析，与别人比较觉得条带不亮，而且背景很白。我想着下一步做DGGE，不知道行不行。
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专注于最重要的那件事，但也不要拒绝其他的
4楼2013-06-19 08:39:32
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