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henghengyouyou银虫 (正式写手)
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表达载体构建的若干问题,谢谢大家。 已有2人参与
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PCR产物可以直接连表达载体么? 如题,本人想构建植物过表达载体,再设计引物时候考虑了点问题。请教一下大家。 我看很多人也是通过扩增后连接到中间载体(T 载体或者其他),这样做第一步要测序验证,挑选正确克隆,通过酶切、连接等步骤连接到表达载体上。 1. 如果我用高保真酶将目的片段扩增(引物带有内切酶接头和保护碱基),纯化回收酶切后,是否可以直接连上表达载体?这样是不是效率很低,是不是要求回收产物量很多?我知道连接后肯定要挑多个单克隆测序验证的。是不是连接到中间载体上获得的正确克隆酶切连接会更容易些? 2.带有接头和饱和碱基的PCR扩增产物(NEB,longamp taq)能否连接到T载体上,上面说在扩增后3 END有个a,我觉得应该可以? 3.在载体上的酶切位点选择时候,是必须选择相隔较远的酶site么?挨着肯定不行???一个酶切了后,另一个内切酶结合不上去? 4. 载体上有的内切酶没并不是粘性末端,平末端也可以用于连接表达载体么? 5.我将ORF连接到PBI121上时候,是否需要考虑移码问题,我的意思是直接在ORF前,TAA后直接加入内切酶的识别序列和保护碱基就行? 6. 我只是想做基因的功能验证,目前没有计划做GUS,在我的目的基因保留TAA的情况下,留着GUS应该没问题吧,没必要吧GUS切掉吧? 7. 我将基因的promoter region 连接到GUS前面,是不是就可以知道该基因的组织表达情况? 8.在构建中间载体时候,比如T载体,如果T载体上面和表达载体上面没有相同可用的内切酶,是不是只能在设计引物时候加入酶切序列和保护碱基了,如果有的话,当然就不用考虑了,直接引物扩增连T,然后连表达载体。 9.我看有文章是将包括promoter+orf+3end的基因组序列直接连入到不含有35s的载体上,这样是不是不需要考虑移码了,直接连接进去就可以了? 问题较多,非常感谢大家。 谢谢各位! |
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wangqi1107
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【答案】应助回帖
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| 一次问2-3个吧,你一下子问这么多谁能回答啊!!!纯化酶切后可以直接连表达载体!目的片段加多点解决连接效率低的问题。扩增后3‘加A的产物,纯化后可以直接连T载体。挨着的酶如果是常用的内切酶,可以双酶切的话,切开是没问题的。最好用粘性末端的酶,链接容易;平末端的酶也能连,效率比较低,连接时间延长至16小时。不用考虑移码问题的,真核表达载体可以识别起始密码子。GUS留着可以做GUS染色,初步筛选转基因阳性植株。组织表达情况,好像不是用这个载体,用它的同类载体PBI101应该更好。第8你说的正确。promoter+orf+3end这样构建到表达载体上更好,表达情况更准确。 |
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henghengyouyou
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