应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 系统发育树做出来怪怪的。。。
51/1返回列表
查看: 2398  |  回复: 10
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

alittlebirdy

铜虫 (初入文坛)

[求助] 系统发育树做出来怪怪的。。。

本人是学环境的，原来没有接触过这方面知识~用mega5做出来的发育树是图中的样子，33是我的样品，这个图是不是不能用？是不是我的序列有问题啊？
求教！

33.jpg
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2013-04-30 13:31:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

alittlebirdy

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 馨沁 at 2013-05-04 20:12:39
应该可以 系统发育树就是说明你菌株的进化关系，序列比对基本上就鉴定到属了，不过一般16SrRNA是一千五百bp左右啊

我用的引物pcr完就只有200bp了。。
赞一下 回复此楼
5楼2013-05-05 12:06:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 11 个回答

馨沁

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
alittlebirdy(gyesang代发): 金币+1, 鼓励回帖应助！ 2013-05-02 01:15:26
模式菌株选择的问题建树流程为 将你的序列输入NCBI，找出与其相似性为99%或100%，的菌种 然后将属名
输入http://www.straininfo.net/的搜索栏中，找到该属的模式菌株，每个种找出一个有代表性的细菌
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2013-04-30 18:23:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

alittlebirdy

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 馨沁 at 2013-04-30 18:23:49
模式菌株选择的问题建树流程为 将你的序列输入NCBI，找出与其相似性为99%或100%，的菌种 然后将属名
输入http://www.straininfo.net/的搜索栏中，找到该属的模式菌株，每个种找出一个有代表性的细菌

没有明白。。。我的序列可用部分只有150个碱基左右，在那个NCBI比完之后，将下面给出的结果都选上了，用MEGA5做出来的图就是上面那种情况，算法用的是neighbor-joining，但是用maximum parsimony法做的看起来就好一些，如图。但是我不懂能不能用maximum parsimony法来做。
目前还有一个月就答辩了，才开始做这个。。。

34.jpg
赞一下 回复此楼
3楼2013-05-01 21:09:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

馨沁

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
alittlebirdy(gyesang代发): 金币+1, 鼓励回帖应助！ 2013-05-06 02:21:07
应该可以 系统发育树就是说明你菌株的进化关系，序列比对基本上就鉴定到属了，不过一般16SrRNA是一千五百bp左右啊
赞一下 回复此楼
4楼2013-05-04 20:12:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 11 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[公派出国] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 9/450 2026-10-11 22:34 by XQNyDCa1Tk5n
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 22:26 by XQNyDCa1Tk5n
[公派出国] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 10/500 2026-10-11 22:26 by XQNyDCa1Tk5n
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 9/450 2026-10-11 22:15 by XQNyDCa1Tk5n
[考博] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 22:11 by XQNyDCa1Tk5n
[基金申请] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 9/450 2026-10-11 22:06 by XQNyDCa1Tk5n
[教师之家] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 (EPI+-1)(金币-50) +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 10/500 2026-10-11 22:06 by XQNyDCa1Tk5n
[有机交流] OpenAI又攻克数学难题了，离AI做有机合成还有多远？ +3 wangyl_123 2026-10-10 6/300 2026-10-11 15:04 by Abin0406
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 (EPI+-1)(金币-50) +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 10/500 2026-10-11 14:25 by VOMexwnDzOFZ
[教师之家] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 (EPI+-1)(金币-50) +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 14:05 by VOMexwnDzOFZ
[考研] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 13:51 by VOMexwnDzOFZ
[硕博家园] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 13:45 by VOMexwnDzOFZ
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 10:54 by VOMexwnDzOFZ
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 10:34 by VOMexwnDzOFZ
[考博] 招收博士生一名 +3 mandolin 2026-10-10 3/150 2026-10-11 10:21 by 不是山谷！
[教师之家] 课题组会帮你通过考核么？ +3 好运来～9527 2026-10-10 5/250 2026-10-11 09:00 by 好运来～9527
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 4/200 2026-10-11 03:14 by M0zrYVSAnxpE
[有机交流] 各位大佬，路线设计求助 +6 zapen 2026-10-08 8/400 2026-10-10 15:59 by zapen
[基金申请] 入职后第一次管课题组的专利缴费，对账才发现官费比别人多掏了一倍 +5 13108017953 2026-10-08 5/250 2026-10-10 11:15 by wdwd123
[有机交流] 我应该选哪条合成路线让实验成功率高一些？ +5 jing816y 2026-10-08 9/450 2026-10-10 09:05 by zapen
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭