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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » DS给蛋白上面氨基酸活性打分
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畅_畅

木虫 (小有名气)

[求助] DS给蛋白上面氨基酸活性打分

才接触DS没多久，想请教各位前辈一个比较实际的问题：我在做一种新型的药物载体，是在原有的蛋白A上面连接新的基团B，已知蛋白上面有21个赖氨酸，但是我多次试验验证其中只有6、7个赖氨酸的氨基与我连接的新基团B反应了，现在的问题是不知道能不能用DS拟合一下我这6,7个基团B是连接到原来蛋白A的哪几个赖氨酸上面的？不知道是否可以对蛋白A上赖氨酸的活性进行打分，按照活性高低排序？因为只有知道了新载体的大致构象才能进一步做下面的新载体与靶蛋白的拟合，来证明新载体具有新型的靶向性。还希望高手不吝赐教！！
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1楼 2013-04-17 20:12:33
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畅_畅

木虫 (小有名气)
来个大侠解答一下啊~~~~
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2楼2013-04-18 16:00:40
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