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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 怎么样可以确定pdb文件疏水性？
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wanglang1987

铜虫 (小有名气)

[求助] 怎么样可以确定pdb文件疏水性？

如提，怎么样可以确定pdb文件疏水性？我做完动力学模拟，怎么样确定其疏水性能的大小？可以统计出表面氨基酸的亲疏水性质吗？需要用什么方法？
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1楼 2013-04-17 20:06:09
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jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
氨基酸的亲疏水性能是确定的吧，你把你的PDB文件导入到VMD，直接选择疏水的残基即可显示：
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2楼2013-04-17 21:15:27
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abigrabbit

金虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2013-04-27 17:07:14
亲疏水性可以利用Discovery显示 亲水性 与疏水性；
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3楼2013-04-27 17:02:41
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