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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 请教关于序列比对
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mengbiotech

金虫 (小有名气)

[求助] 请教关于序列比对

大家好
我现在使用BLAST比对A与B两条序列，请问BLAST会自动与B比对序列A的反向互补序列吗？

请指导！
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热爱生活，热爱生命
1楼 2013-04-13 15:35:13
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gaoyang636

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
不会自动对反补序列进行比对的，如果需要对序列和反补序列都进行比对，可以使用FASTA
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2楼2013-04-13 16:04:00
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mengbiotech

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by gaoyang636 at 2013-04-13 16:04:00
不会自动对反补序列进行比对的，如果需要对序列和反补序列都进行比对，可以使用FASTA

我使用的是BLAST中的Alignment.
试了一下已知相似性的两条序列比对，再用其反向互补序列比对，仍然是原来的相似性数值。
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热爱生活，热爱生命
3楼2013-04-13 16:13:45
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