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mengbiotech

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专业: 环境微生物学

[求助] 请教关于序列比对

大家好
我现在使用BLAST比对A与B两条序列，请问BLAST会自动与B比对序列A的反向互补序列吗？

请指导！

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热爱生活，热爱生命

1楼 2013-04-13 15:35:13

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mengbiotech

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引用回帖:

2楼: Originally posted by gaoyang636 at 2013-04-13 16:04:00
不会自动对反补序列进行比对的，如果需要对序列和反补序列都进行比对，可以使用FASTA

我使用的是BLAST中的Alignment.
试了一下已知相似性的两条序列比对，再用其反向互补序列比对，仍然是原来的相似性数值。

热爱生活，热爱生命

3楼2013-04-13 16:13:45

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gaoyang636

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【答案】应助回帖

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不会自动对反补序列进行比对的，如果需要对序列和反补序列都进行比对，可以使用FASTA

2楼2013-04-13 16:04:00

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