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guanqinana

新虫 (初入文坛)

[求助] 怎么使用NCBI克隆基因?

要克隆一个物种的一个基因,之前没有在该物种上克隆过,要怎么使用NCBI来找到克隆的序列呢?另外该物种在NCBI上面还是找不到的怎么办呢?
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hellolin

金虫 (小有名气)

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感谢参与,应助指数 +1
guanqinana(myprayer代发): 金币+1, 赠人玫瑰手有余香,鼓励应助,分子生物版块期待你的更多精彩。 2013-04-11 08:19:42
找近源物种的该基因序列进行比对,然后设计简并引物扩中间片段,然后做RACE就可以了
scienceguy
2楼2013-04-11 00:01:34
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guanqinana

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by hellolin at 2013-04-11 00:01:34
找近源物种的该基因序列进行比对,然后设计简并引物扩中间片段,然后做RACE就可以了

那是要找多少个近源物种进行比对呢,两个够吗?
3楼2013-04-11 10:20:12
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hellolin

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
guanqinana: 金币+2 2013-04-12 11:50:57
引用回帖:
3楼: Originally posted by guanqinana at 2013-04-11 10:20:12
那是要找多少个近源物种进行比对呢,两个够吗?...

如果是两个很近缘的物种的话两个也可以,不过我们一般用三个以上
scienceguy
4楼2013-04-11 15:59:57
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hxm007199

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
直接在NCBI上检索该物种的基因名称就可以了
生可忍,熟不可忍!
5楼2013-04-11 17:31:07
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hxm007199

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

如果搜索不到,说明该物种该基因还没有人做全测序,只能用相近物种的相同基因两端去找保守区域设计引物,然后利用这个通用引物去扩增所要物种的总DNA,看看能不能获得该基因片段(扩增产物测序)

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生可忍,熟不可忍!
6楼2013-04-11 17:33:47
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guanqinana

新虫 (初入文坛)

送红花一朵
引用回帖:
6楼: Originally posted by hxm007199 at 2013-04-11 17:33:47
如果搜索不到,说明该物种该基因还没有人做全测序,只能用相近物种的相同基因两端去找保守区域设计引物,然后利用这个通用引物去扩增所要物种的总DNA,看看能不能获得该基因片段(扩增产物测序)

是不是每个基因的保守区域都是一样的呢?
7楼2013-04-12 11:50:31
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崔永霞

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
引用回帖:
5楼: Originally posted by hxm007199 at 2013-04-11 17:31:07
直接在NCBI上检索该物种的基因名称就可以了

您好,想问一下,如果只找到一个基因序列怎么办啊?
每个人都有心底最柔软的地方,请不要触碰它,因为每个人都有自己的尊严!
8楼2013-04-12 16:21:37
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