| 查看: 10965 | 回复: 9 | ||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||
[求助]
急！急！急！对转录组测序结果进行验证，如何选定基因
|
||
|
急！急！急！转录组测序后，得到大量差异表达的基因，现在要对差异表达的基因做实时定量PCR验证，有点迷茫了，那么多差异表达的基因应该怎么选呢？ 可以按以下原则选吗？ 1 差异表达的倍数，倍数越高越好 2 p值和FDR值越小越好，有很多是0的，那是不是选2者值均为0的呢 3 选择的基因是否要在两个样本中都表达呢？有的差异倍数很高，但是只在一个样本中表达，在另一个中表达量为0，这样的可以选择做验证吗？ 有没有哪位大侠做过此类实验，请不吝赐教！ |
回复此楼» 猜你喜欢
不合理蛙科研实验之“鼠逃三次我发三篇SCI”
已经有0人回复
-
纳米粒度分析
已经有3人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有199人回复
-
林科院林化所招收材料与化工专业硕士，坐标南京
已经有0人回复
-
留学--博士招生
已经有16人回复
-
化学工程，本211，求调剂，ab区不限
已经有4人回复
-
湖北师范大学招调剂啦
已经有6人回复
-
邵阳学院食品与化学工程学院硕士调剂
已经有0人回复
-
天津商业大学 生物与医药课题组招生
已经有0人回复
-
生物化工学硕招收调剂
已经有0人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 转录组测序还是基因组测序？
已经有6人回复
- 转录组测序所需RNA提取
已经有14人回复
- 《求助》 转录组样品，混合与分开测序的区别？！！！
已经有13人回复
- 转录组和蛋白质组测序分析接种后感病和抗病植物能分析到什么水平
已经有5人回复
- Illumina solexa转录组测序
已经有8人回复
- 植物转录组测序
已经有19人回复
- 2011NSFC申请时写的用基因芯片，现在准备改成转录组测序，不知这样调整行不行？
已经有6人回复
- 转录组测序 可行性
已经有12人回复
- 求高人帮忙解读一下关于水稻转录组测序的文献
已经有1人回复
- 求高人翻译关于水稻转录组测序的一段摘要
已经有1人回复
- 【资料】番茄基因组完成测序（附Nature全文）
已经有73人回复
- 抗寒胁迫下，做转录组测序的取样部位问题。
已经有6人回复
- 已取得基因反向测序结果，要先如何处理再上blast比对？
已经有4人回复
- 一个关于全基因组测序的问题
已经有6人回复
- 怎么进行转录组分析
已经有6人回复
- 转录组数据分析免费软件
已经有11人回复
- 转录组研究前沿
已经有21人回复
- 请问高通量测序中深度和覆盖度是什么意思？
已经有12人回复
- 上海晶能转录组测序可靠吗？
已经有5人回复
- 【求助/交流】请教达人：转录组测序北京哪个公司做得出色、可靠一些？
已经有9人回复
shucanwei
木虫 (正式写手)
- 应助: 13 (小学生)
- 金币: 4809.2
- 散金: 70
- 红花: 3
- 帖子: 464
- 在线: 72.7小时
- 虫号: 994653
- 注册: 2010-04-12
- 性别: GG
- 专业: 天体力学和人造卫星动力学
7楼2013-06-30 08:51:22
2楼2013-04-10 21:46:50
foreverlukel
新虫 (初入文坛)
- 应助: 2 (幼儿园)
- 金币: 65.5
- 红花: 2
- 帖子: 30
- 在线: 9.3小时
- 虫号: 2403299
- 注册: 2013-04-06
- 专业: 免疫生物学
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
你是我的幸福(myprayer代发): 金币+1, 赠人玫瑰手有余香。期待你的慷慨解囊。快乐每一天 2013-04-25 16:56:19
你是我的幸福: 金币+5, ★有帮助 2013-04-25 21:40:02
kx444555: 金币+3, 鼓励交流 2013-06-04 12:37:59
你是我的幸福(myprayer代发): 金币+1, 赠人玫瑰手有余香。期待你的慷慨解囊。快乐每一天 2013-04-25 16:56:19
你是我的幸福: 金币+5, ★有帮助 2013-04-25 21:40:02
kx444555: 金币+3, 鼓励交流 2013-06-04 12:37:59
|
首先希望你不只是为了验证而验证，最好还有其他意义，这样就要看你选什么样的基因了。 其次你说的那些条件都算在挑选基因的原则，但只是最开始筛选基因的原则，等把基因找到了之后，也许这个基因都设计不出来合适的引物，所以可以找到基因后看看能不能按照实时定量引物设计原则设计出好的引物。 最后你说的在一个样本中表达，在另一个样本中表达，这不正是你想要的差异么，实时定量就是为了看他表达的动态过程。转录组测序得到的基因表达量只能作为参考，不能下定论，所以刚才你说的在另一个样本中不表达也是不一定的事，都要经过验证的。 祝楼主成功发表好文章！  |
3楼2013-04-25 15:25:58
4楼2013-05-13 20:28:39
