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你是我的幸福

新虫 (正式写手)

应助: 1 (幼儿园)
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[求助] 急！急！急！对转录组测序结果进行验证，如何选定基因

急！急！急！转录组测序后，得到大量差异表达的基因，现在要对差异表达的基因做实时定量PCR验证，有点迷茫了，那么多差异表达的基因应该怎么选呢？
可以按以下原则选吗？
  1 差异表达的倍数，倍数越高越好
  2 p值和FDR值越小越好，有很多是0的，那是不是选2者值均为0的呢
  3 选择的基因是否要在两个样本中都表达呢？有的差异倍数很高，但是只在一个样本中表达，在另一个中表达量为0，这样的可以选择做验证吗？
有没有哪位大侠做过此类实验，请不吝赐教！

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1楼2013-04-09 10:43:17

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macore

银虫 (小有名气)

应助: 2 (幼儿园)
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专业: 基因表达调控与表观遗传学

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
你是我的幸福(myprayer代发): 金币+1, 赠人玫瑰手有余香，鼓励应助，分子生物版块期待你的更多精彩。 2013-04-11 08:20:58
你是我的幸福: 金币+3, ★有帮助 2013-04-25 21:40:18
kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2013-06-04 12:37:43

一般是采用以上标准，另外可以结合信号通路和基因功能。但是有时候不是差异倍数越高的越好。祝你好运啊

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2楼2013-04-10 21:46:50

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