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沙漠肥牛

铁虫 (初入文坛)

[求助] 关于RNA提取的求助

各位大神,求助!最近在做病毒的RNA提取实验,实际上,本人算是第一次接触分子实验,水平有点渣。用的是试剂盒提取,做了挺多次的了吧,有时候PCR能出来,有时候不能。测OD的结果显示,260/280很多在1.5-1.7左右,甚至1.4的都有,好像说是蛋白质污染严重??想问下,这个情况大概是什么原因啊?还有,这个情况我应该注意什么?
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liyu0355

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
沙漠肥牛: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-03-15 08:40:03
测OD的结果并不能说明什么

最好做电泳(琼脂糖凝胶电泳),看是否三条带.28S,18S,5S.且5S最弱.
如果RNA质量好,28S和18S的比例大约是2:1.

我用过promega公司的.
不过现在
我们实验用常规的方法TRIzol来提取RNA.


蛋白污染:
裂解 Buffer中加新鲜样品不能太多,也不能太少。太多裂解不充分,太少得率少。
       
特别是在转移新管时,不能碰到沉淀。
2楼2013-03-14 17:35:47
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wolaiyefeng

铁杆木虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by liyu0355 at 2013-03-14 17:35:47
测OD的结果并不能说明什么

最好做电泳(琼脂糖凝胶电泳),看是否三条带.28S,18S,5S.且5S最弱.
如果RNA质量好,28S和18S的比例大约是2:1.

我用过promega公司的.
不过现在
我们实验用常规的方法TRIzol来提取R ...

你好,我近期想做RNA提取,能把你的提取具体步骤分享下么,十分感谢!!!
3楼2013-12-30 16:46:54
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liyu0355

木虫 (正式写手)

应用TRIzol LS提取病毒RNA
所提取物为血清、血液、细胞培养液、鸡胚尿囊液等液体中的病毒。提取时尽量在人少时进行,防止空气中RNA酶的污染。所用一切物品也应是无RNA酶的。
1.1 在1.5ml的eppendorf管中加入病毒原液500ul,再加入TRIzol LS 500ul,充分混匀,室温放置10min。
1.2 加入200ul的氯仿,盖紧离心管盖,用力震荡离心管(溶液充分乳化,成乳白状,无分相现象),室温放置10min (由于氯仿沸点低、易挥发,振荡时离心管可能爆开,小心)。
1.3 离心 4℃、13000r/min、15min,取上层液相移入另一管(切忌吸动白色中间相)。
1.4 加入等体积异丙醇,轻轻颠倒离心管充分混匀液体,室温放置10min。
1.5 离心 4℃、13000r/min、15min,(这时乍一看会发现管子里好像没有东西,再仔细看看,会发现靠近管底的壁上有一星点的白色沉淀物,就是它了)用枪小心吸去所有上清。
1.6 1ml75%乙醇洗一遍,离心 4℃、8000r/min、10min,(这时又会发现管子没东西了,不要担心,有的,但是因为量太少看不见罢了)用枪小心吸去所有上清,在超净台中干燥5min。
1.7 加入适量DEPC处理水。(如果材料来源丰富的话,加入的水量为下一步RT的total减去其他试剂的量;若要省着点用,则自己看着办了,尽量不要加太多的水)。
1.8 建议立即做RT。若要保存,可在上一步加入乙醇后冻存于-70℃,可保存一年;若加入DEPC水后则只能在-20℃保存1个月左右。
4楼2013-12-31 09:51:28
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