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ann花开花落

铜虫 (正式写手)

[求助] 退火温度的优化

退火温度的优化,看到书上说比Tm低2-10℃的范围内,由高到低的设定同一反应体系中连续的不同循环的退火温度,可以避免同时做多个平行试验的繁琐操作,这个我没懂,能不能帮忙解释下呢
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mascotte

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
amisking: 回帖置顶 2013-02-28 19:02:09
ann花开花落: 金币+3, ★★★很有帮助, 懂了 2013-03-01 11:24:06
gyesang: 金币+2, 鼓励交流! 2013-04-10 17:46:19
楼上说的都对,举例来说:你的引物计算Tm值为58度,在支持Touchdown PCR的PCR仪里可以设定第一个循环的退火温度为68(比计算值高10度),第二个为66.第三个为64....每个循环的退火温度比前一个低1~2度,直到降到58度,并以58度继续进行PCR剩余的循环数。这样可以极大的减少非特异性的扩增。
4楼2013-02-28 18:25:04
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mascotte

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

我一般是前5个循环做touchdown, 第一个循环比引物的TM高10度,第二个高8度,。。。第六个循环至第30个循环按照引物的Tm进行退火
7楼2013-04-09 21:21:01
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