24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
汕头大学海洋科学接受调剂
查看: 6383  |  回复: 7
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

finesand

铜虫 (小有名气)

[求助] 怎样在ncbi blast的比对结果上找到最相似的序列呢

怎样在ncbi blast的比对结果上找到最相似的序列呢?在我的结果里有些Max ident高的序列Max score却低,覆盖率这一项又应该怎么考虑呢?哪一项是首要的,应该如何结合着看呢?像下面的结果应该怎样取舍,从左到右的是Max score,Total score,Query coverage, E value ,Max ident.很是困惑,请大家多多指教,如果可以麻烦大家尽快回复,情况比较着急!谢谢!

360桌面截图20130124093826.jpg
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

生物信息学

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chenguestc

木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
引用回帖:
3楼: Originally posted by finesand at 2013-01-24 21:18:07
谢谢!顺便问下:Program selection选择Somewhat similar sequences ( blastn ) 得出的结果分值较低,出现较多其他物种的序列,如果我的目的是要找最相似序列选择highly similar sequences (megablast)可以吗?

是的,如果你只需要高同源性的,就选highly similar sequences 就行了
4楼2013-01-25 10:50:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答

gastrodia

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
finesand: 金币+1, ★★★很有帮助, 迟到的谢谢!O(∩_∩)O谢谢 2013-02-15 23:32:50
从上到下,得分最高就是最相似的序列,
2楼2013-01-24 10:35:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

finesand

铜虫 (小有名气)

谢谢!顺便问下:Program selection选择Somewhat similar sequences ( blastn ) 得出的结果分值较低,出现较多其他物种的序列,如果我的目的是要找最相似序列选择highly similar sequences (megablast)可以吗?
3楼2013-01-24 21:18:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ll小可mir

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
是滴,点一下最上面的那个,就可以按照那个进行排名~
5楼2013-01-25 22:08:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 材料工程281还有调剂机会吗 +38 xaw. 2026-04-11 39/1950 2026-04-14 13:04 by wanganpin
[考研] 材料工程085601,270求调剂 +41 @ASDF1234 2026-04-08 44/2200 2026-04-14 09:23 by barlinike
[考研] 305求调剂 +8 玛卡巴卡boom 2026-04-11 8/400 2026-04-14 09:04 by pengliang8036
[考研] 22专硕求调剂 +8 haoyun上岸 2026-04-11 10/500 2026-04-13 22:15 by zhq0425
[基金申请] 2026 WR青拔 +3 冬日阳光CAS 2026-04-09 6/300 2026-04-13 18:40 by liuchb715
[考研] 339求调剂 +4 hanwudada 2026-04-12 4/200 2026-04-13 12:03 by 蓝云思雨
[考研] 0831生医工第一轮调剂失败求助 +12 小熊睿睿_s 2026-04-11 16/800 2026-04-12 16:28 by 钰璞
[考研] 一志愿华中农微生物,288分,三年实验经历 +11 代fish 2026-04-09 11/550 2026-04-12 10:21 by Hayaay
[考研] 291分调剂 +5 上岸小莹加油 2026-04-09 6/300 2026-04-11 21:06 by 逆水乘风
[考研] 070300化学279求调剂 +19 哈哈哈^_^ 2026-04-08 20/1000 2026-04-11 20:43 by stoner78
[考研] 296求调剂 +14 汪!?! 2026-04-08 15/750 2026-04-11 20:28 by dongdian1
[考研] 求调剂,一志愿大连理工大学354分 +5 雨声余生 2026-04-11 6/300 2026-04-11 16:12 by 雨声余生
[考研] 346,工科求调剂 +3 moser233 2026-04-09 3/150 2026-04-11 10:04 by zhq0425
[考研] 中药学调剂 初试324 +4 洋甘菊、 2026-04-10 6/300 2026-04-11 09:41 by gong120082
[考研] 281求调剂 +11 觉得好的吧 2026-04-10 11/550 2026-04-11 09:35 by 逆水乘风
[考研] 22408调剂求助 +7 毂12 2026-04-09 9/450 2026-04-11 09:23 by 哦哦123
[考研] 263能源动力专硕求调剂 +4 加大号饭盒袋 2026-04-10 4/200 2026-04-10 20:52 by gong120082
[考研] 机械专368 有去处吗 +4 种大树 2026-04-10 4/200 2026-04-10 15:31 by jiajinhpu
[考研] 一志愿华东师范生物学326分,求调剂 +8 刘墨墨 2026-04-09 8/400 2026-04-10 12:00 by pengliang8036
[考研] 085404,285分求调剂 +12 薇薇考研 2026-04-07 14/700 2026-04-09 23:10 by parmtree
信息提示
请填处理意见