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为什么我的DNA 非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳 跑成这个鬼样?
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porphybaby
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专业: 化学生物学与生物有机化学
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为什么我的DNA 非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳 跑成这个鬼样?
如图所示。
最左边是 一个突变的单链DNA序列 是呈单链结构的 含27个碱基
第二个是 经过退火的一个四链体DNA序列 呈G-四链体结构 也含27个碱基
再往右边走 它们都是加了我的药物处理的DNA 可是会发现 根本就没有条带 跑都跑不出来??这是怎么回事? 所用的药物浓度与DNA的比例倍数是1,2,3,4、、、8
在4度下 TBE缓冲液中 80V 电泳 2.5小时 然后银染 的 结果
我想问下 为啥 条带都没有了呢????
DNA电泳图.jpg
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1楼
2013-01-21 16:56:14
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cdl007
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2013-01-23 16:01:40
觉的你样品提取的有问题,或者确实药物将DNA降解了,还有,从你泳道口的残痕判断,从你加药开始的几个条带就有问题,加样孔残留过多,上下贯穿的黑条带,排除电泳问题的话,应该是DNA不规则碎片,各种长度都有,所以有长的带,后面随药物浓度加大,似乎dna完全被降解,跑出泳道了,
建议重新提取样品,采用新的试剂体系和电泳体系,如果还是同样问题,很可能你的药不止嵌合DNA,而且是将其降解,药物浓度越大,降解越彻底。
不知道其它虫友怎么解释
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6楼
2013-01-22 14:20:34
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cdl007
木虫
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amisking: 金币+2, 鼓励发帖交流问题。
2013-01-21 20:20:04
amisking: 回帖置顶
2013-01-21 20:20:07
DNA降解?
看你样品顺序,药越多,条带越差,你的药物怎么作用的DNA啊?
好像把条带稀释了的样子,是不是与上样缓冲液有关?
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2楼
2013-01-21 17:15:59
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mzhyan
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感觉不对啊,很乱啊,是不是药物给污染了。
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3楼
2013-01-21 17:47:00
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porphybaby
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2楼
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cdl007
at 2013-01-21 17:15:59
DNA降解?
看你样品顺序,药越多,条带越差,你的药物怎么作用的DNA啊?
好像把条带稀释了的样子,是不是与上样缓冲液有关?
就是 可能是 插入DNA啊 或者是 跟DNA的沟槽结合咯~~
理论上它会促进 不同构型的 DNA 转换
但 按理来说 应该有条带啊 就是没有 怎么做都没有。。。
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4楼
2013-01-21 21:48:17
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