24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 1695  |  回复: 11
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

18988582

银虫 (正式写手)

[求助] 新手求助PCR产物Blast问题,先谢谢大家了

目的基因是HSP90
我在NCBI设计了一对引物,产物长度大概为300bp,但是跑出来的结果,电泳显示为500bp,拿去测序发现结果为500bp,在ncbi上进行比对,结果显示为下图,中间有一个GAP,求问为什么呢?

还有一个问题是正向测序和反向测序结果有什么区别,我两个方向都测了,结果不太一样啊!

反向测序结果.jpg



正向测序.jpg
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

坚持我的!
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiazhiwuxie

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小丹木木: 金币+2, 鼓励应助 2013-01-12 22:10:29
正反向测序的2个结果是反向互补的,但不能确定到底哪一个是反向互补哪一个是标准的。你这个结果,两个引物之间是300bp,出现了500bp条带,应该是非特异性扩增了。你要blast后面的文字结果比较下,是不是其他物种,基因名称和你一样的?
7楼2013-01-12 17:02:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 12 个回答

夏尔list

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
引物不好吧,扩出非特异性条带了。
2楼2013-01-12 16:22:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

18988582

银虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 夏尔list at 2013-01-12 16:22:13
引物不好吧,扩出非特异性条带了。

谢谢回复,产物测序后有部分序列比对是正确的啊。我做的这个生物的HSP90在ncbi上没有数据。

你看主要还是引物问题吗?
坚持我的!
3楼2013-01-12 16:24:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

夏尔list

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

300bp的话,不知道是连载体测,还是直接PCR产物测的。一般测序引物那段几十bp测不出来的。
4楼2013-01-12 16:27:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 085404 293求调剂 +6 勇远库爱314 2026-04-08 6/300 2026-04-09 15:45 by wp06
[考研] 工科273调剂 +3 X1999 2026-04-09 4/200 2026-04-09 15:44 by 释放天性
[考研] 085501机械专硕 302分 不挑专业求调剂 +5 汪某. 2026-04-09 5/250 2026-04-09 15:38 by 蒋皓禹
[考研] 268分085602化学工程调剂 +14 月照花林。 2026-04-09 14/700 2026-04-09 15:12 by Sealedwind
[考研] 0703化学 +31 妮妮ninicgb 2026-04-04 34/1700 2026-04-09 14:58 by only周
[考研] 一志愿上海大学生物学346 +4 上海大学346调剂 2026-04-03 4/200 2026-04-09 10:52 by yiminglu
[考研] 化工学硕 285求调剂 +26 Wisjxn 2026-04-07 26/1300 2026-04-08 14:42 by screening
[考研] 一志愿生物与医药,296分,求调剂 +14 66鹿 2026-04-03 16/800 2026-04-08 10:38 by tjzhao
[考研] 288环境专硕,求调材料方向 +35 lllllos 2026-04-04 39/1950 2026-04-07 23:24 by 一只好果子?
[考研] 325 调剂 +6 QQ小虾 2026-04-07 6/300 2026-04-07 15:17 by Ccclqqq
[考研] 305分求调剂 +3 哈_哈_哈_哈_哈 2026-04-04 5/250 2026-04-07 14:49 by 哈_哈_哈_哈_哈
[考研] 333求调剂 +6 合乘杨习夕 2026-04-06 6/300 2026-04-07 09:44 by 猪会飞
[考研] 复试调剂 +14 呼呼?~+123456 2026-04-05 14/700 2026-04-06 22:50 by chenzhimin
[考研] 285求调剂 +5 mapmath 2026-04-06 6/300 2026-04-06 17:18 by 蓝云思雨
[考研] 一志愿9材料学硕297已过六级求调剂推荐 +11 adaie 2026-04-04 12/600 2026-04-05 19:04 by 蓝云思雨
[考研] 288求调剂 一志愿哈工大 材料与化工 +13 洛神哥哥 2026-04-03 13/650 2026-04-05 17:27 by zzx2138
[考研] 调剂 +4 是可乐不是可乐 2026-04-04 4/200 2026-04-04 19:41 by 唐沐儿
[考研] [调剂信息]085408光电信息 求调剂 总分291分数一英一 +3 iz11az 2026-04-02 3/150 2026-04-04 19:09 by 蓝云思雨
[考研] 286求调剂 +8 lim0922 2026-04-02 8/400 2026-04-03 20:19 by rzh123456
[考研] 081200-11408-276学硕求调剂 +5 崔wj 2026-04-03 5/250 2026-04-03 15:06 by arrow8852
信息提示
请填处理意见