24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 1692  |  回复: 11
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

18988582

银虫 (正式写手)

[求助] 新手求助PCR产物Blast问题,先谢谢大家了

目的基因是HSP90
我在NCBI设计了一对引物,产物长度大概为300bp,但是跑出来的结果,电泳显示为500bp,拿去测序发现结果为500bp,在ncbi上进行比对,结果显示为下图,中间有一个GAP,求问为什么呢?

还有一个问题是正向测序和反向测序结果有什么区别,我两个方向都测了,结果不太一样啊!

反向测序结果.jpg



正向测序.jpg
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

坚持我的!
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

夏尔list

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

300bp的话,不知道是连载体测,还是直接PCR产物测的。一般测序引物那段几十bp测不出来的。
4楼2013-01-12 16:27:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 12 个回答

夏尔list

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
引物不好吧,扩出非特异性条带了。
2楼2013-01-12 16:22:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

18988582

银虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 夏尔list at 2013-01-12 16:22:13
引物不好吧,扩出非特异性条带了。

谢谢回复,产物测序后有部分序列比对是正确的啊。我做的这个生物的HSP90在ncbi上没有数据。

你看主要还是引物问题吗?
坚持我的!
3楼2013-01-12 16:24:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

18988582

银虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 夏尔list at 2013-01-12 16:27:09
300bp的话,不知道是连载体测,还是直接PCR产物测的。一般测序引物那段几十bp测不出来的。

我是PCR产物直接测序的,还有那个GAP是怎么回事呢?
坚持我的!
5楼2013-01-12 16:31:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 求调剂,262机械专硕 +5 嗯yyl 2026-04-08 5/250 2026-04-08 23:27 by 6781022
[考研] 270求调剂 +3 031127 2026-04-06 4/200 2026-04-08 21:00 by 逆水乘风
[考研] 325分化学调剂 +9 15771691647 2026-04-02 9/450 2026-04-08 19:21 by ruoyu867
[考研] 266求调剂 +18 阳阳哇塞 2026-04-07 18/900 2026-04-08 12:59 by grayjzr
[考研] 本科生物信息学,总分362 求07 08调剂 +6 q小倩1210 2026-04-06 6/300 2026-04-07 19:40 by macy2011
[考研] 287求调剂 +3 通信学硕081000 2026-04-03 4/200 2026-04-06 21:03 by going home
[考研] 324求调剂 +3 k可乐 2026-04-05 4/200 2026-04-06 09:54 by 蓝云思雨
[考研] 材料调剂 +6 一样YWY 2026-04-05 6/300 2026-04-05 20:30 by 南航~万老师
[考研] 22408 总分320,一篇论文二作,两个国三,求调剂 +3 Leomulufu 2026-04-04 5/250 2026-04-05 19:04 by chongya
[考研] 326求调剂 +3 顾若浮生 2026-04-05 3/150 2026-04-05 18:32 by 蓝云思雨
[考研] 296求调剂 +3 汪!?! 2026-04-05 5/250 2026-04-05 17:38 by 蓝云思雨
[考研] 288求调剂 一志愿哈工大 材料与化工 +13 洛神哥哥 2026-04-03 13/650 2026-04-05 17:27 by zzx2138
[考研] 284求调剂 +7 徐同学_001 2026-04-04 13/650 2026-04-05 17:19 by yulian1987
[考研] 工科08专硕机械275求调剂 +3 AaAa7420 2026-04-02 3/150 2026-04-05 13:26 by jp9609
[考研] 考研调剂 +3 mcbbc 2026-04-04 3/150 2026-04-05 10:03 by barlinike
[考研] 325求调剂 +4 春风不借意 2026-04-04 4/200 2026-04-04 22:08 by 啵啵啵0119
[考研] 085600调剂 +4 1amJJ 2026-04-02 4/200 2026-04-04 21:53 by hemengdong
[考研] 309求调剂 +4 快乐的小白鸽 2026-04-04 5/250 2026-04-04 15:55 by cql1109
[考研] 考研调剂 +3 15615482637 2026-04-03 3/150 2026-04-03 22:50 by ms629
[考研] 071000生物学调剂 +8 知昭蔓 2026-04-02 8/400 2026-04-03 10:36 by macy2011
信息提示
请填处理意见