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北木

新虫 (小有名气)

应助: 5 (幼儿园)
金币: 668.3
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虫号: 977329
注册: 2010-03-21
专业: 理论和计算化学

[求助] gromacs 模拟云母遇到的问题

我建的模型基底上用的云母里面有Al和K，我用的是ffG43a2力场。生成top文件时，我在力场文件里写上了Al的参数，但是K的不知道该怎么办？
我把K去掉生成的top文件，把K单独写了itp文件，不知道这样会有什么影响？
这样做了，又有另外的问题了，跑动力学时出现Al的原子类型不能识别。。。怎么办呢？
求指点。。。。谢谢啦！

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1楼2012-12-24 17:26:45

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lockey-s

新虫 (小有名气)

应助: 0 (幼儿园)
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在线: 41.3小时
虫号: 1363677
注册: 2011-08-09
专业: 有机高分子功能材料

求问楼主的问题解决了吗？

7楼2017-09-20 04:47:07

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