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GloveJ

新虫 (小有名气)

[求助] DNA琼脂糖凝胶电泳结果分析

分子生物学菜鸟一个,现在在做摇菌提质粒(空质粒),电泳结果理解不了,请大侠们帮帮忙,小女子先在此谢谢了。
1.marker是10000的;
2.另外三个空加的是不同次提的同样的质粒,质粒大小是7500bp;
3.胶是新配的1%的,电泳液也是新配的,电压是80v。跑胶时间30mins;
问题:
1.怎么条带跑出来这么难看,连marker都是那么让人失望;
2.我提的质粒大小是7500bp,这个怎么跑出来比10000还大呢;
3.每个孔怎么跑出来多条带呢?

20121126晚上全部用新的跑pcdh.Tif(1.25MB)
http://kuai.xunlei.com/d/GDDUAQVUGUFU?p=130497
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CXL19880406

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小丹木木: 金币+3, 鼓励应助 2012-11-28 13:55:11
1.有可能枪头扎到孔了,跑的条带两头重;marker最后加样,先加了有可能会这样;琼脂胶搅拌不均匀,没凝好。这都有可能。
2.觉得有可能提的是基因组了,质粒没提出来啊……
3.这个真心不清楚啊。
另外,不知道是不是电压的原因,我是120V,20分钟搞定。祝实验成功~
2楼2012-11-28 12:03:04
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winner00lk

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你提出的不是你需要的质粒是可以肯定的,7500的质粒即使因为线性与超螺旋的区别也不会相差这么大,那么条带很有可能是基因组DNA了,因为基因组在提取质粒的时候是会被打碎的,所以随着跑胶时间的增加是可以看到多条带的;而且你的琼脂糖凝胶应该是配置时间较长,或者在没有完全溶解就开始泠凝导致胶块的密度不够均一,导致了你的marker条带很难看。
我从远方来,没带走一丝遗憾
3楼2012-11-29 14:26:24
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