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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 其他 » 没有合适的模板只有序列还有方法模建么？
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黑藻先生

银虫 (小有名气)

[求助] 没有合适的模板只有序列还有方法模建么？

SWISS和MODULLER都用过了 没有合适的模板因此STOP了
请问下只有序列没有模板还有什么方法能够模建么？

新人=。=没几个币所以给的比较少 请谅解.....

PS 我搜过其他帖子了有说改用thread法和ROSETTA软件
不知道还有没有别的方法

因为个人数据量比较大一种方法可能不准

[ Last edited by 黑藻先生 on 2012-11-4 at 21:33 ]
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1楼 2012-11-04 21:30:37
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黑藻先生

银虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by scusmf at 2012-11-06 09:59:55
要看你的蛋白质链有多长，残基太多的话，用从头预测或穿线法的计算量就会太大，而且准确性不高；如果是新手在没有合适模板的情况下，最好就不要建模了，准确性真心太差。

现在只是我一个师姐需要我建模 她是做实验方面的 不会
不长 只有400多个
这个已经被我不知道用什么方法反正模出来了..........准确性尚未知///
（主要是海投啊终于收到两封有结构的回件 因为有别的事还没怎么好好研究）

有模板的感觉准确性也不高
我现在正在做的有几百个文件需要建模
用SWISS的问题是即使是有PDB结构的 拿序列（删除一些不必要的）去 一个本来球形的模出来螃蟹型大八字

帮师姐做那个其实也没什么事 不过主要是我做模建的师姐也不知道怎么做我就上来问问=。=
总之还是谢谢!
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3楼2012-11-06 21:55:46
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scusmf

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
黑藻先生: 金币+1, ★有帮助, 一些建议 2012-11-06 21:56:17
zh1987hs: 金币+2, 谢谢 2012-11-06 22:57:49
要看你的蛋白质链有多长，残基太多的话，用从头预测或穿线法的计算量就会太大，而且准确性不高；如果是新手在没有合适模板的情况下，最好就不要建模了，准确性真心太差。
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2楼2012-11-06 09:59:55
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