24小时热门版块排行榜    

查看: 367  |  回复: 2

黑藻先生

银虫 (小有名气)

[求助] 没有合适的模板只有序列还有方法模建么?

SWISS和MODULLER都用过了 没有合适的模板因此STOP了
请问下只有序列没有模板还有什么方法能够模建么?

新人=。=没几个币所以给的比较少 请谅解.....

PS 我搜过其他帖子了有说改用thread法和ROSETTA软件
不知道还有没有别的方法

因为个人数据量比较大一种方法可能不准

[ Last edited by 黑藻先生 on 2012-11-4 at 21:33 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

scusmf

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
黑藻先生: 金币+1, 有帮助, 一些建议 2012-11-06 21:56:17
zh1987hs: 金币+2, 谢谢 2012-11-06 22:57:49
要看你的蛋白质链有多长,残基太多的话,用从头预测或穿线法的计算量就会太大,而且准确性不高;如果是新手在没有合适模板的情况下,最好就不要建模了,准确性真心太差。
2楼2012-11-06 09:59:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

黑藻先生

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by scusmf at 2012-11-06 09:59:55
要看你的蛋白质链有多长,残基太多的话,用从头预测或穿线法的计算量就会太大,而且准确性不高;如果是新手在没有合适模板的情况下,最好就不要建模了,准确性真心太差。

现在只是我一个师姐需要我建模 她是做实验方面的 不会
不长 只有400多个
这个已经被我不知道用什么方法反正模出来了..........准确性尚未知///
(主要是海投啊终于收到两封有结构的回件 因为有别的事还没怎么好好研究)

有模板的感觉准确性也不高
我现在正在做的有几百个文件需要建模
用SWISS的问题是即使是有PDB结构的 拿序列(删除一些不必要的)去 一个本来球形的模出来螃蟹型大八字

帮师姐做那个其实也没什么事 不过主要是我做模建的师姐也不知道怎么做我就上来问问=。=
总之还是谢谢!
3楼2012-11-06 21:55:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 黑藻先生 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 不应该看fileCode +4 且听虎啸 2026-08-12 4/200 2026-08-12 12:40 by 行无人
[基金申请] 奇怪,两个人的filecode固定段从头到尾一模一样 +7 布布和一二 2026-08-10 10/500 2026-08-12 09:12 by 布布和一二
[基金申请] 帮忙看看fileCode +7 wwncly 2026-08-10 13/650 2026-08-11 19:36 by 冰心玉壶晴
[基金申请] 为什么网上很多人说本周 12号出结果 +6 瞬息宇宙 2026-08-10 7/350 2026-08-11 19:25 by Tide man
[硕博家园] 读博的好处 +3 lnee 2026-08-11 3/150 2026-08-11 18:10 by 希望我好好的
[基金申请] 听说今天filecode变了 +26 布布和一二 2026-08-06 49/2450 2026-08-11 13:18 by WH3796
[基金申请] 我的国基提前知道中了,可是同事的操作让我实在接受不了,怎么会有这样的人 +8 家与远方 2026-08-10 13/650 2026-08-11 09:49 by 家与远方
[基金申请] 基金中了 +15 laoda193707 2026-08-06 15/750 2026-08-11 00:11 by jiafei2190
[基金申请] 确定了,国自然21号放榜 +6 布布和一二 2026-08-10 7/350 2026-08-10 19:15 by 2000zf36392
[基金申请] 关于代码变化问题,想知道的进来 +17 且听虎啸 2026-08-07 24/1200 2026-08-10 18:35 by zhangduo2008
[基金申请] 静等基金结果 +5 gjjjzhong 2026-08-10 16/800 2026-08-10 17:19 by Tide man
[基金申请] 好奇怪的filecode +4 布布和一二 2026-08-08 5/250 2026-08-10 14:20 by 冰心玉壶晴
[基金申请] 这样的filecode谁见过 +11 布布和一二 2026-08-08 22/1100 2026-08-10 11:10 by wmfsnow
[基金申请] fileCode有新解读? +10 Tide man 2026-08-08 18/900 2026-08-09 12:55 by 仁砚薪传
[基金申请] 国基金的申报应该改成非等额制,评价高的钱多评价低的钱少,但是增加资助率 +7 a089 2026-08-07 7/350 2026-08-08 18:05 by gltch
[基金申请] 关于filecode +4 布布和一二 2026-08-07 7/350 2026-08-07 22:55 by zhanghaozhu
[基金申请] 化学口download_prp&fileCode的固定段好像这几天一直没变,有变的大神么? +3 Tide man 2026-08-07 4/200 2026-08-07 22:39 by Tide man
[基金申请] 固定端突然变了,今天 +6 archvillain 2026-08-06 10/500 2026-08-07 16:03 by 医学老男孩
[基金申请] filecode +8 布布和一二 2026-08-06 11/550 2026-08-06 20:41 by tangpu318
[基金申请] 影响面上的因素 +8 布布和一二 2026-08-05 11/550 2026-08-06 10:41 by 宝贝虫子
信息提示
请填处理意见