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lxyyzz

木虫 (小有名气)

[求助] 富含脯氨酸的蛋白质为什么在进行SDS-PAGE的时候,分子量会比本来的分子量大很多? 已有1人参与

RT,求高人解释,SDS-PAGE不是本来剔除了电荷的影响么。
另外,到底什么样的算脯氨酸“富集”?
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2008430117

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
lxyyzz: 金币+5, ★有帮助, 谢谢交流~ 2012-11-09 10:01:46
小丹木木: 金币+3, 鼓励交流问题 2012-11-09 14:29:43
1.有可能不是富含脯氨酸的原因
2.上面提到是纯化的蛋白,有没有可能这种蛋白含有较多的半胱氨酸,有可能出现3.的情况
3.在跑大分子构象复杂的蛋白质分子时,常会出现在泳道顶端(有时在浓缩胶中)的一些大分子未知条带或加样孔底部有沉淀,主要由于还原剂在加热的过程中被氧化而失去活性,致使原来被解离的蛋白质分子重新折叠结合和亚基重新缔合,聚合成大分子,其分子量要比目标条带大,有时不能进入分离胶。但它却于目标条带有相同的免疫学活性,在WB反应中可见其能与目标条带对应的抗体作用。  
4. 处理办法:在加热煮沸后,再添加适量的DTT或Beta巯基乙醇,以补充不足的还原剂;或可加适量EDTA来阻止还原剂的氧化。
我也是新手,希望对你有帮助。。。。
想+做=想做
7楼2012-11-08 19:17:07
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查看全部 11 个回答

lxyyzz

木虫 (小有名气)

没有人知道么。。。
2楼2012-10-10 09:01:33
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sj082csh

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
lxyyzz: 金币+5, ★有帮助, 谢谢回复~ 2012-10-13 09:48:51
小丹木木: 金币+2, 鼓励交流 2012-10-16 13:48:55
据说是这样的:1.亲水性高,碱性蛋白,结合的SDS数目较少,因此电泳时偏慢
              2.因其容易受糖基化修饰,所以其表观分子量较计算出的分子量大
3楼2012-10-12 22:29:01
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lxyyzz

木虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by sj082csh at 2012-10-12 22:29:01
据说是这样的:1.亲水性高,碱性蛋白,结合的SDS数目较少,因此电泳时偏慢
              2.因其容易受糖基化修饰,所以其表观分子量较计算出的分子量大

关于这个问题:
1. 脯氨酸是疏水性氨基酸,不属于碱性氨基酸啊;SDS跟蛋白结合与蛋白的什么性质有关?
2. 这个我也知道。但是我做过一些截短蛋白,有的蛋白脯氨酸含量也很高(比如某段氨基酸序列,30个氨基酸里面有9个脯氨酸),但是就没有出现分子量偏大的现象。这种情况怎么解释?

另外还有一个问题。有的富含脯氨酸的蛋白质,纯化的结果是两条带。一条与实际分子量差不多,一条要多很多,两条带的分子量差十几kDa。WB的结果表明,这两个条带都是这个蛋白。我觉得这种现象可能跟脯氨酸有关系。请问这种现象是否也有合理的解释?
望不吝告知~
谢谢!
4楼2012-10-13 09:59:47
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