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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 富含脯氨酸的蛋白质为什么在进行SDS-PAGE的时候，分子量会比本来的分子量大很多？
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lxyyzz

木虫 (小有名气)

[求助] 富含脯氨酸的蛋白质为什么在进行SDS-PAGE的时候，分子量会比本来的分子量大很多？已有1人参与

RT，求高人解释，SDS-PAGE不是本来剔除了电荷的影响么。
另外，到底什么样的算脯氨酸“富集”？
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1楼2012-10-09 09:52:36
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sj082csh

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
lxyyzz: 金币+5, ★有帮助, 谢谢回复~ 2012-10-13 09:48:51
小丹木木: 金币+2, 鼓励交流 2012-10-16 13:48:55
据说是这样的：1.亲水性高，碱性蛋白，结合的SDS数目较少，因此电泳时偏慢
              2.因其容易受糖基化修饰，所以其表观分子量较计算出的分子量大
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3楼2012-10-12 22:29:01
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lxyyzz

木虫 (小有名气)
没有人知道么。。。
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2楼2012-10-10 09:01:33
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lxyyzz

木虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by sj082csh at 2012-10-12 22:29:01
据说是这样的：1.亲水性高，碱性蛋白，结合的SDS数目较少，因此电泳时偏慢
              2.因其容易受糖基化修饰，所以其表观分子量较计算出的分子量大

关于这个问题：
1. 脯氨酸是疏水性氨基酸，不属于碱性氨基酸啊；SDS跟蛋白结合与蛋白的什么性质有关？
2. 这个我也知道。但是我做过一些截短蛋白，有的蛋白脯氨酸含量也很高（比如某段氨基酸序列，30个氨基酸里面有9个脯氨酸），但是就没有出现分子量偏大的现象。这种情况怎么解释？

另外还有一个问题。有的富含脯氨酸的蛋白质，纯化的结果是两条带。一条与实际分子量差不多，一条要多很多，两条带的分子量差十几kDa。WB的结果表明，这两个条带都是这个蛋白。我觉得这种现象可能跟脯氨酸有关系。请问这种现象是否也有合理的解释？
望不吝告知~
谢谢！
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4楼2012-10-13 09:59:47
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sj082csh

银虫 (小有名气)
★
小丹木木: 金币+1, 热心的虫虫 2012-11-09 14:29:29
引用回帖:
4楼: Originally posted by lxyyzz at 2012-10-13 09:59:47
关于这个问题：
1. 脯氨酸是疏水性氨基酸，不属于碱性氨基酸啊；SDS跟蛋白结合与蛋白的什么性质有关？
2. 这个我也知道。但是我做过一些截短蛋白，有的蛋白脯氨酸含量也很高（比如某段氨基酸序列，30个氨基酸里面 ...

1.正如您所说，脯氨酸属于极性分子的非极性氨基酸，是疏水性氨基酸
2.我只是个热心的网友，对这方面不了解，是个门外汉，是因为对您的问题很感兴趣，才回复的。嘻嘻，所以帮不上你忙了。。
3.查阅文献也没查出个所以然来。。
4.是不是跟您的蛋白质种类有关呢? 如您第二条所述，可能并不仅仅是因为脯氨酸。
5.要是您找到了问题的答案，能否发个消息给我，不甚感激。
6.打扰了，抱歉，没帮上忙
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5楼2012-10-13 21:44:03
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