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lxyyzz

木虫 (小有名气)

[求助] 富含脯氨酸的蛋白质为什么在进行SDS-PAGE的时候,分子量会比本来的分子量大很多?已有1人参与

RT,求高人解释,SDS-PAGE不是本来剔除了电荷的影响么。
另外,到底什么样的算脯氨酸“富集”?
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sj082csh

银虫 (小有名气)


小丹木木: 金币+1, 热心的虫虫 2012-11-09 14:29:29
引用回帖:
4楼: Originally posted by lxyyzz at 2012-10-13 09:59:47
关于这个问题:
1. 脯氨酸是疏水性氨基酸,不属于碱性氨基酸啊;SDS跟蛋白结合与蛋白的什么性质有关?
2. 这个我也知道。但是我做过一些截短蛋白,有的蛋白脯氨酸含量也很高(比如某段氨基酸序列,30个氨基酸里面 ...

1.正如您所说,脯氨酸属于极性分子的非极性氨基酸,是疏水性氨基酸
2.我只是个热心的网友,对这方面不了解,是个门外汉,是因为对您的问题很感兴趣,才回复的。嘻嘻,所以帮不上你忙了。。
3.查阅文献也没查出个所以然来。。
4.是不是跟您的蛋白质种类有关呢? 如您第二条所述,可能并不仅仅是因为脯氨酸。
5.要是您找到了问题的答案,能否发个消息给我,不甚感激。
6.打扰了,抱歉,没帮上忙
5楼2012-10-13 21:44:03
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lxyyzz

木虫 (小有名气)

没有人知道么。。。
2楼2012-10-10 09:01:33
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sj082csh

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
lxyyzz: 金币+5, 有帮助, 谢谢回复~ 2012-10-13 09:48:51
小丹木木: 金币+2, 鼓励交流 2012-10-16 13:48:55
据说是这样的:1.亲水性高,碱性蛋白,结合的SDS数目较少,因此电泳时偏慢
              2.因其容易受糖基化修饰,所以其表观分子量较计算出的分子量大
3楼2012-10-12 22:29:01
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lxyyzz

木虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by sj082csh at 2012-10-12 22:29:01
据说是这样的:1.亲水性高,碱性蛋白,结合的SDS数目较少,因此电泳时偏慢
              2.因其容易受糖基化修饰,所以其表观分子量较计算出的分子量大

关于这个问题:
1. 脯氨酸是疏水性氨基酸,不属于碱性氨基酸啊;SDS跟蛋白结合与蛋白的什么性质有关?
2. 这个我也知道。但是我做过一些截短蛋白,有的蛋白脯氨酸含量也很高(比如某段氨基酸序列,30个氨基酸里面有9个脯氨酸),但是就没有出现分子量偏大的现象。这种情况怎么解释?

另外还有一个问题。有的富含脯氨酸的蛋白质,纯化的结果是两条带。一条与实际分子量差不多,一条要多很多,两条带的分子量差十几kDa。WB的结果表明,这两个条带都是这个蛋白。我觉得这种现象可能跟脯氨酸有关系。请问这种现象是否也有合理的解释?
望不吝告知~
谢谢!
4楼2012-10-13 09:59:47
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