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阳性克隆的筛选问题
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xuyan_1215
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阳性克隆的筛选问题
请教各位虫友,最近我在做连接,在转化之后挑取平板上的单菌落进行菌落pcr,结果显示为阳性的克隆却在双酶切的时候没有目的片段,而且测序也没有信号。请问这是怎么回事呢?用什么方法检验阳性克隆比较科学呢?(注:菌落pcr时阴阳性对照都设置了,阴性没P出来,阳性P出来的条带比菌落亮)
[
Last edited by xuyan_1215 on 2012-9-19 at 17:15
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2012-09-19 17:11:12
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xuyan_1215
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8楼
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Originally posted by
lidonghong
at 2012-09-20 17:13:44
嗯 你要是觉得工作量大的话 就可以从你的菌落PCR阳性结果中,选取3到4个条带特别亮的菌落来进行扩大培养和进一步的鉴定!...
嗯,好的,不妨这样做做看。。。谢谢!!
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9楼
2012-09-20 18:45:43
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无疆@行者
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菌液PCR快速,简单,通量大,但是有假阳性率,一般就是菌液PCR后,酶切鉴定,然后测序,如果经费充足,或者节省时间的话,就是菌液PCR,然后直接测序。一般测序结果是判断标准
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2楼
2012-09-19 18:17:10
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xuyan_1215
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2楼
:
Originally posted by
无疆@行者
at 2012-09-19 18:17:10
菌液PCR快速,简单,通量大,但是有假阳性率,一般就是菌液PCR后,酶切鉴定,然后测序,如果经费充足,或者节省时间的话,就是菌液PCR,然后直接测序。一般测序结果是判断标准
我也是这样做的,每次做完菌液pcr就送样测序,但是结果总是无信号,这假阳性的概率也太大了。。。
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3楼
2012-09-20 07:09:31
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lidonghong
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xuyan_1215: 金币+5,
★★★
很有帮助
2012-09-20 14:41:19
菌落PCR只能初步的判断下是否连接转化成功,但是假阳性率是非常高的,原因是因为裂解液残留的问题,你可以把你挑的几个阳性克隆进行扩大培养,然后提取质粒做质粒PCR和质粒酶切,这样就能确保没问题。
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生物化学与分子生物学
4楼
2012-09-20 08:03:45
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