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克隆假阳性的问题
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asdfghjkl-00
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]
克隆假阳性的问题
最近一直在做克隆,蓝白筛选长的白斑也不少,送去测序也有系列,但是一比对,就是载体序列,请问这是怎么回事啊?是阳性率太低了吗?是不是连接效率太低导致的阳性率也低?怎么提高连接效率啊?各位高手们帮忙解决一下吧。。。。
[
Last edited by asdfghjkl-00 on 2011-7-31 at 10:10
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1楼
2011-07-31 10:05:51
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healerly
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dhd997(金币+5, MolEPI+1): 非常热心,破格奖励 2011-07-31 17:51:27
既然有蓝白色菌斑,说明可以转进质粒去。测序不成功,结果是空载体说明是假阳性。楼主是不是用的试剂盒?现在试剂盒载体自连的概率是很小的。
问题1:楼主不进行白色菌斑的PCR鉴定以及双酶切鉴定吗?
问题2:楼主的目的片段是多少?连接多少时间?
建议:1,在测序之前进行阳性菌株的鉴定。
2,如果是长片段的话,建议连接过夜,可以提高连接效率。
希望楼主尽快找到问题~~实验顺利
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heal the world!!!
2楼
2011-07-31 15:20:11
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mayonghong
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【答案】应助回帖
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1949stone(金币+3): 学习下 2011-07-31 20:47:23
在测序前建议先进行菌液PCR进行验证,但是有的时候菌液PCR容易假阳性,也可以提质粒,电泳进行验证,现在酶连都是试剂盒,我们一般酶连时间:16℃酶连4h,或者4℃酶连过夜,还有酶连时间也不是越长越好,另外做实验室实验手法也很重要,一定要注意细节问题。
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一生有你
3楼
2011-07-31 20:28:01
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gwbk
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专业: 生物化学
问一个比较弱的问题,载体是什么?宿主是什么?有蓝斑吗?
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4楼
2011-07-31 22:47:52
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