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构质粒ING

新虫 (初入文坛)

[求助] 【SOS】EcoRI单酶切连接不上

各位大侠,求助!
    目的片段3000bp,在PCR时两端均加上EcoRI酶切位点,PCR后,连接全式金的pEASY-T1-Simple载体,没问题。载体是整合载体YIP5,由于酶切位点的限制,只有EcoRI可以与我的目的片段连接。YIP5是7000多bp,由于已经插入了一个基因,所以现在是9000多bp。
      目的基因用EcoRI从T载体上切下来,切得还不错,切胶用OMEGA胶回收30微升。载体用EcoRI酶切4个小时,跑电泳看条带切得也不错,回收后,用NEB的CIP去磷酸化处理,37℃,1个小时,CIP加了0.3微升,跑胶回收。
    连接时,载体加1微升,目的片段7微升,Fermentas连接酶0.5微升,22℃,1个小时,转化TOP10。长出来不到十个菌落,菌落PCR全不对。我也尝试过用未经过磷酸化处理的载体与目的片段连接,长出很多,菌落PCR也不多。折腾有快3个月了,就是连不上。快要疯了。跪求求各位帮忙!!!
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张宏宇123

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
构质粒ING: 金币+1, ★★★很有帮助 2012-05-28 11:41:24
小丹木木: 金币+2, 鼓励应助 2012-05-28 15:58:51
你有没有提过质粒看看,从你长出来的菌里提的质粒跟你载体比是不是一样大小,或者是比你载体还小?你载体很大,又回收了两次,我怀疑你载体是不是断的比较多。我们实验室载体7000bp的都有很多断的情况。
你可以把你磷酸化处理好的载体做一个阴性对照,看你载体处理的如何,如果阴性对照都长很多的话,那说明你载体处理的不好。
连接的时候片段还可以加多一些。
呵呵,希望你成功。
未来不是梦
2楼2012-05-28 10:59:16
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张宏宇123

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
西瓜: 金币+2, 说得好呢 2012-05-28 22:00:01
引用回帖:
3楼: Originally posted by 构质粒ING at 2012-05-28 11:08:39
谢谢你的帮助。
    有几次菌落PCR有条带,摇菌提质粒就发现小了,小到只有4000多bp了。那看来是断裂了。您说把磷酸化的载体做阴性对照的意思,是把处理过的载体也转化TOP10么?
    由于我们实验室不能测片段的 ...

阴性对照就是让你的载体去连接,然后转化TOP10,看看长不长,连接的时候可以多加片段,尽量多加。
不过首先得把载体处理好,载体处理不好连接肯定还是困难。你去磷酸化后可以酚仿抽提回收,不用胶回收试剂盒看看,断的会不会少一些。
未来不是梦
5楼2012-05-28 14:16:29
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张宏宇123

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
8楼: Originally posted by 构质粒ING at 2012-05-28 17:39:35
那做载体阴性对照的时候,还用把载体加T4连接酶连接吗?还是说直接把处理过载体转化TOP10?...

要加,就是不加片段,体系用水不足。
未来不是梦
12楼2012-05-29 09:43:25
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