| 查看: 1135 | 回复: 5 | |||
不喜欢豆芽木虫 (小有名气)
|
[求助]
QM/MM计算出错
|
| 大家好，我在用QM/MM跑蛋白质体系，一直无法顺利进行，今天好不容易有个结果出来了，结果体系还跑飞了，在计算的过程中就有很多*，不知道是结构太不合理了还是怎么了？我在跑QM/MM之前，先用sybyl简单的优化了一下，不知道谁有类似的经历，麻烦指点一下，谢谢了！附件是我的输入文件和输出文件。 |
回复此楼» 本帖附件资源列表
-
欢迎监督和反馈：小木虫仅提供交流平台，不对该内容负责。
本内容由用户自主发布，如果其内容涉及到知识产权问题，其责任在于用户本人，如对版权有异议，请联系邮箱：xiaomuchong@tal.com - 附件 1 : model_3AU7_min50_type.gjf
- 附件 2 : model_3AU7_min50_type.log
2012-05-24 14:57:01, 528.98 K
2012-05-24 14:58:42, 1.17 M
» 猜你喜欢
Comsol 6.0 桶内肥料产热产湿过程模拟求助
已经有1人回复
-
南京大学软物质计算模拟方向硕博连读/直博生招生
已经有0人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有177人回复
-
International Journal of Nanoscience属于中科院4区吗？
已经有0人回复
-
博士生招生, 材料模拟方向，University of South Carolina
已经有0人回复
-
博士生招生, 材料模拟方向，University of South Carolina
已经有1人回复
-
美国杰克逊州立大学周剑歌教授的化学计算与AI实验室诚聘博士后研究员
已经有4人回复
-
博士生招生, 材料模拟方向，University of South Carolina
已经有1人回复
-
澳大利亚南昆士兰大学量子点课题组招收博士生
已经有0人回复
-
博士生招生, 材料模拟方向，University of South Carolina
已经有0人回复
-
Tc数据拟合
已经有0人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 过渡态~qst3出错
已经有11人回复
- AMBER加热时出现问题
已经有5人回复
- 用高斯QM/MM算频率和QST3
已经有8人回复
- 用MS模拟中，用COMPASS力场计算AL2O3的力场，总是找不到AL-O的键
已经有8人回复
- Amber 分子动力学 求助！！！！
已经有10人回复
- QM/MM计算金属蛋白时，Gaussview无法读入与金属相连氨基酸的amber力场参数。
已经有6人回复
- QM/MM和QMCF方法原理
已经有9人回复
- QM/MM计算中如何添加Pb的amber力场参数？
已经有8人回复
- Gaussian的oniom计算中固定MM区优化报错
已经有9人回复
- AMBER的amberpdb命令出错问题
已经有4人回复
- 使用Amber进行QM/MM动力学模拟
已经有5人回复
- 急求nwchem应用实例
已经有11人回复
- 关于amber动力学模拟中MM/GBSA的问题
已经有7人回复
- AMBER中qm/mm的问题
已经有5人回复
- [求助]QM/MM联用
已经有11人回复
- 【求助】关于Gaussian计算中的能量问题
已经有14人回复
- 【求助】打算从amber学起
已经有16人回复
2楼2012-05-28 11:39:44
不喜欢豆芽
木虫 (小有名气)
- 应助: 9 (幼儿园)
- 金币: 5428.4
- 红花: 2
- 帖子: 220
- 在线: 243.2小时
- 虫号: 1240243
- 注册: 2011-03-21
- 性别: MM
- 专业: 理论和计算化学
3楼2012-05-28 21:34:12
不喜欢豆芽
木虫 (小有名气)
- 应助: 9 (幼儿园)
- 金币: 5428.4
- 红花: 2
- 帖子: 220
- 在线: 243.2小时
- 虫号: 1240243
- 注册: 2011-03-21
- 性别: MM
- 专业: 理论和计算化学
4楼2012-05-28 22:16:07
5楼2012-05-29 10:47:47
不喜欢豆芽
木虫 (小有名气)
- 应助: 9 (幼儿园)
- 金币: 5428.4
- 红花: 2
- 帖子: 220
- 在线: 243.2小时
- 虫号: 1240243
- 注册: 2011-03-21
- 性别: MM
- 专业: 理论和计算化学
6楼2012-05-30 09:25:21
