应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » Gaussian的oniom计算中固定MM区优化报错
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
101/1返回列表
查看: 2933  |  回复: 9
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

雨萍

银虫 (小有名气)

[求助] Gaussian的oniom计算中固定MM区优化报错

所进行的计算是固定MM区，只对QM区进行几何构型优化，MM区是用amber立场优化过的，现在为了节省机时，在接下来的优化中固定住MM区，但不知道为什么会出现这样的错误，请指教～～
输入文件是：
%chk=0.chk
%mem=16GB
%nproc=12
# opt oniom(cam-b3lyp/6-311+g(d,p):amber) geom=connectivity

Title Card Required

0 1 1 1 1 1
N-N3-0.141400    -1  -52.27363600   40.48805300   22.80701600 L
C-CT-0.096200    -1  -52.09407400   41.78122000   23.49292300 L
C-C-0.616300     -1  -50.82731500   42.53639500   23.06929900 L
O-O--0.572200    -1  -50.78030500   43.74798800   23.29408700 L
C-CT--0.059700   -1  -52.19672800   41.66212700   25.01801000 L
H-HC-0.030000    -1  -51.38680600   41.05351300   25.41318500 L
H-HC-0.030000    -1  -53.15529500   41.22412700   25.28983200 L
H-HC-0.030000    -1  -52.13627200   42.65455200   25.46490700 L
H-HP-0.088900    -1  -52.92767500   42.40850700   23.17849300 L
H-H-0.199700     -1  -53.18776600   40.10552900   23.02615600 L
H-H-0.199700     -1  -51.57081900   39.82211000   23.10504900 L
H-H-0.199700     -1  -52.22921400   40.59750800   21.80646300 L
N-N--0.347900    -1  -49.84589400   41.90893900   22.39114600 L
C-CT--0.263700   -1  -48.79908700   42.60105500   21.61078000 L
C-C-0.734100     -1  -49.43181900   43.73931300   20.79779200 L
O-O--0.589400    -1  -50.39136800   43.51561700   20.06688700 L
C-CT--0.000700   -1  -48.04391500   41.59692600   20.71650700 L
C-CT-0.039000    -1  -47.12551600   40.67180000   21.53646900 L
C-CT-0.048600    -1  -46.26387800   39.73597300   20.68070100 L
N-N2--0.529500   -1  -47.05859800   38.72735100   19.95305100 L
C-CA-0.807600    -1  -46.67667600   37.50702800   19.62360600 L
N-N2--0.862700   -1  -45.53813700   36.99392600   19.96412000 L
N-N2--0.862700   -1  -47.45601100   36.74139400   18.91965200 L
H-H1-0.156000    -1  -48.09063200   43.03647800   22.31510100 L
H-HC-0.032700    -1  -47.42691500   42.15197300   20.00781600 L
H-HC-0.032700    -1  -48.76329300   41.00094100   20.15253400 L
H-HC-0.028500    -1  -47.71657000   40.06616100   22.21658100 L
H-HC-0.028500    -1  -46.45474000   41.28746900   22.13659700 L
H-H1-0.068700    -1  -45.56537300   39.23913900   21.35318400 L
H-H1-0.068700    -1  -45.68229500   40.32414400   19.96929300 L
H-H-0.345600     -1  -47.99612200   38.96183700   19.65409800 L
H-H-0.447800     -1  -45.34955800   36.04625300   19.69306400 L
H-H-0.447800     -1  -44.97569700   37.41071000   20.71650000 L
H-H-0.447800     -1  -47.21381000   35.75750900   18.88802500 L
H-H-0.447800     -1  -48.37536700   37.07027500   18.66427900 L
H-H-0.274700     -1  -49.81127500   40.88870000   22.42319900 L
N-N--0.415700    -1  -48.95969100   44.96892500   21.03332100 L
C-CT--0.038900   -1  -49.79504300   46.19286600   21.09563700 L
C-C-0.597300     -1  -50.73760500   46.47279900   19.91921400 L
O-O--0.567900    -1  -51.76690900   47.11395300   20.12567200 L
C-CT-0.365400    -1  -48.94340800   47.43505400   21.39954300 L
O-OH--0.676100   -1  -49.77467300   48.50209600   21.79201700 L
C-CT--0.243800   -1  -48.08137700   47.91115600   20.22901800 L
H-H1-0.100700    -1  -50.45204700   46.05994400   21.95663600 L
H-H1-0.004300    -1  -48.28236800   47.20152300   22.23505700 L
H-HO-0.410200    -1  -50.54870400   48.49516300   21.21118800 L
H-HC-0.064200    -1  -48.70472500   48.26011100   19.40505000 L
H-HC-0.064200    -1  -47.45314100   48.73816800   20.55954800 L
H-HC-0.064200    -1  -47.44135500   47.10095000   19.87999800 L
H-H-0.271900     -1  -48.14379000   44.97059200   21.62197700 L
N-N--0.347900    -1  -50.38506600   46.04505200   18.70562600 L
C-CT--0.240000   -1  -51.25214300   45.94901900   17.52714700 L
C-C-0.734100     -1  -50.83846700   44.71054000   16.72568700 L
O-O--0.589400    -1  -49.67322700   44.32305000   16.74410000 L
C-CT--0.009400   -1  -51.16382200   47.23795900   16.67336000 L
C-CT-0.018700    -1  -52.25134400   48.28460500   16.97916400 L
C-CT--0.047900   -1  -53.68149200   47.79273300   16.66245300 L
C-CT--0.014300   -1  -54.46450500   48.69660600   15.69620500 L
N-N3--0.385400   -1  -53.91185000   48.71642300   14.31969300 L
H-H-0.340000     -1  -53.93714900   47.82097500   13.83112700 L
H-H-0.340000     -1  -52.95126500   49.01377800   14.32546800 L
H-H-0.340000     -1  -54.38736100   49.42644100   13.75749000 L
H-HP-0.113500    -1  -55.50167100   48.35806400   15.65876900 L
H-HP-0.113500    -1  -54.46305900   49.71489300   16.09801000 L
H-HC-0.062100    -1  -53.66407200   46.78031900   16.26295800 L
H-HC-0.062100    -1  -54.23281300   47.75201500   17.60286100 L
H-HC-0.010300    -1  -52.19449600   48.56855100   18.02908000 L
H-HC-0.010300    -1  -52.03780300   49.18326100   16.40040300 L
H-HC-0.036200    -1  -50.18096300   47.69580800   16.80291000 L
H-HC-0.036200    -1  -51.25464700   46.98502200   15.62055300 L
H-H1-0.142600    -1  -52.27730100   45.78980700   17.86137700 L
H-H-0.274700     -1  -49.53194400   45.50210900   18.65030900 L
N-N--0.415700    -1  -51.79162500   44.12342400   16.00427700 L
C-CT--0.003100   -1  -51.63154300   43.07842700   14.98129600 L
C-C-0.597300     -1  -51.20429500   41.68006700   15.46863200 L
O-O--0.567900    -1  -51.80598700   40.69603700   15.04984400 L
C-CT--0.003600   -1  -50.71720100   43.54473900   13.83314200 L
C-CT--0.064500   -1  -50.91770900   44.98072000   13.32730500 L
C-C-0.695100     -1  -52.37661700   45.36491000   13.11943100 L
O-O--0.608600    -1  -53.01871300   45.93575200   13.99431700 L
N-N--0.940700    -1  -52.94554200   45.09135400   11.97332300 L
H-H1-0.085000    -1  -52.62042700   42.93479900   14.54205800 L
H-HC-0.017100    -1  -50.86734200   42.85988600   12.99895400 L
H-HC-0.017100    -1  -49.68156800   43.46098600   14.15902100 L
H-HC-0.035200    -1  -50.37851200   45.10724600   12.39178400 L
H-HC-0.035200    -1  -50.46773000   45.67096300   14.03601900 L
H-H-0.425100     -1  -53.61009100   45.83733700   11.79282500 L
H-H-0.425100     -1  -52.35668000   44.81536700   11.20704800 L
H-H-0.271900     -1  -52.69485700   44.56995500   16.02861900 L
N-N--0.415700    -1  -50.13380900   41.54977900   16.25891900 L
C-CT--0.038900   -1  -49.39077200   40.28411900   16.44124900 L
C-C-0.597300     -1  -50.05314400   39.28977700   17.41949100 L
O-O--0.567900    -1  -49.45365200   38.87491100   18.41499700 L
C-CT-0.365400    -1  -47.92400200   40.56131800   16.83862700 L
O-OH--0.676100   -1  -47.44565100   41.75548000   16.26813400 L
C-CT--0.243800   -1  -46.97263400   39.46658000   16.35816200 L
H-H1-0.100700    -1  -49.36548600   39.78796000   15.47103800 L
H-H1-0.004300    -1  -47.84550800   40.66350100   17.92012900 L
H-HO-0.410200    -1  -47.57918300   41.71527600   15.30144000 L
H-HC-0.064200    -1  -46.92567900   39.45923800   15.26897200 L
H-HC-0.064200    -1  -45.97191800   39.65670700   16.74816100 L
H-HC-0.064200    -1  -47.30552500   38.49396700   16.71567100 L
H-H-0.271900     -1  -49.66235600   42.40621300   16.54027200 L
N-N--0.415700    -1  -51.26938700   38.84113900   17.10216100 L
C-CT-0.033700    -1  -51.89068000   37.62707600   17.64409200 L
C-C-0.597300     -1  -51.22046700   36.35771300   17.05392300 L
O-O--0.567900    -1  -50.07163100   36.42094800   16.58796300 L
C-CT--0.182500   -1  -53.39781600   37.70807700   17.34889200 L
H-H1-0.082300    -1  -51.75741900   37.60767900   18.72585200 L
H-HC-0.060300    -1  -53.92663800   36.87955400   17.82418500 L
H-HC-0.060300    -1  -53.80811000   38.63654700   17.74820300 L
H-HC-0.060300    -1  -53.58010200   37.67303500   16.27374300 L
H-H-0.271900     -1  -51.70904100   39.26522600   16.29197900 L
N-N--0.347900    -1  -51.92076500   35.21182300   17.04375800 L
C-CT--0.263700   -1  -51.44742100   33.96612600   16.41526800 L
C-C-0.734100     -1  -51.07639300   34.16638900   14.94659700 L
O-O--0.589400    -1  -49.90457400   34.02439800   14.61322500 L
C-CT--0.000700   -1  -52.46208200   32.83318600   16.61993400 L
C-CT-0.039000    -1  -51.81503000   31.47409100   16.31730900 L
C-CT-0.048600    -1  -52.85388300   30.37058700   16.45913500 L
N-N2--0.529500   -1  -52.27763400   29.02197100   16.35917600 L
中间省略
H-H1-0.075400    -1   35.83213300   40.92469100   -4.45883000 L
H-H1-0.098500    -1   35.01007200   43.80962200   -2.10724100 L
H-HC-0.071800    -1   33.29215800   45.28672800   -3.55541400 L
H-HC-0.071800    -1   33.06688600   43.53206100   -3.56538900 L
O-O--0.588100    -1   41.77877500   49.45409700   -8.28346000 L
C-C-0.567700     -1   40.96303100   48.56000400   -8.44546900 L
N-NA--0.434000   -1   40.71494600   48.13022600   -9.71855400 L
H-H-0.342000     -1   41.26759500   48.53131400  -10.45324100 L
C-C-0.519400     -1   39.69820400   47.29431000  -10.08350300 L
O-O--0.556300    -1   39.43935400   47.21097000  -11.27114300 L
C-CM-0.002500    -1   38.95762400   46.68326500   -8.98110200 L
C-CT--0.226900   -1   37.84414100   45.68669000   -9.25656200 L
H-HC-0.077000    -1   37.37805100   45.34251700   -8.33171100 L
H-HC-0.077000    -1   38.25064200   44.82504000   -9.78242100 L
H-HC-0.077000    -1   37.08794700   46.14228400   -9.88983500 L
C-CM--0.220900   -1   39.22461800   47.04666200   -7.69980800 L
H-H4-0.260700    -1   38.67611800   46.58414200   -6.88959800 L
N-N*--0.023900   -1   40.19453100   47.99225000   -7.41996800 L
C-CT-0.068000    -1   40.41302200   48.50400700   -6.03869500 L
C-CT--0.085400   -1   39.59290600   49.77815700   -5.78763700 L
H-HC-0.071800    -1   40.09920300   50.41895200   -5.06422100 L
H-HC-0.071800    -1   39.37936300   50.33563600   -6.69975300 L
C-CT-0.071300    -1   38.33893000   49.18424600   -5.17356200 L
O-OH--0.654900   -1   37.58403700   50.10037300   -4.42540900 L
H-HO-0.439600    -1   36.99424200   49.54416500   -3.88708200 L
H-H1-0.098500    -1   37.73163800   48.71458100   -5.94395800 L
C-CT-0.162900    -1   38.93877600   48.10549000   -4.28451400 L
O-OS--0.369100   -1   39.98001000   47.55470500   -5.06678000 L
H-H1-0.117600    -1   39.35965200   48.55953500   -3.38829400 L
C-CT--0.006900   -1   37.92172900   47.03436000   -3.89218000 L
H-H1-0.075400    -1   38.40951500   46.30635600   -3.25106900 L
H-H1-0.075400    -1   37.58745900   46.50992900   -4.78795100 L
O-OS--0.495400   -1   36.78638600   47.56160700   -3.21797800 L
P-P-1.165900     -1   35.79337700   46.56887100   -2.40718500 L
O-O2--0.776100   -1   34.43208600   47.13557300   -2.50575900 L
O-O2--0.776100   -1   36.39449500   46.24663000   -1.11446600 L
H-H2-0.180400    -1   41.48030600   48.70178600   -5.91879300 L


输出文件报错信息是：
  25081        1           0.000000000    0.000000000    0.000000000
  25082        8           0.000000000    0.000000000    0.000000000
  25083       15           0.000000000    0.000000000    0.000000000
  25084        8           0.000000000    0.000000000    0.000000000
  25085        8           0.000000000    0.000000000    0.000000000
  25086        1           0.000000000    0.000000000    0.000000000
-------------------------------------------------------------------
Cartesian Forces:  Max     0.087721664 RMS     0.001364559

GradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGrad
Berny optimization.
Internal  Forces:  Max     0.080588063 RMS     0.017641769
Search for a local minimum.
Step number   1 out of a maximum of  330
All quantities printed in internal units (Hartrees-Bohrs-Radians)
NRF ne Abs NRFX
Error termination via Lnk1e in /vol-th/home/jgao/local/g09/g09/l103.exe at Fri Jul 20 11:26:04 2012.
Job cpu time:  0 days  3 hours 31 minutes 14.3 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF=   1149 Int=      0 D2E=      0 Chk=    738 Scr=      1

另外：之前用oniom计算过别的蛋白质，在固定住MM区优化QM区时，并没有出现过这样的错误。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2012-07-20 11:30:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zeolitedft

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★
雨萍: 金币+2, ★有帮助 2012-08-03 14:08:23
这里只有low层啊, high层的坐标省略了? 还是没有定义high层?
赞一下 回复此楼
2楼2012-07-27 06:52:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

keke1987

新虫 (小有名气)
楼主，问题解决了吗？请问有没有oniom计算实例可以分享下？高层是客体还是低层是客体呢？高低层的计算方法有分别要依据什么来定呢？
赞一下 回复此楼
3楼2012-08-01 16:58:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

雨萍

银虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by zeolitedft at 2012-07-27 06:52:46
这里只有low层啊, high层的坐标省略了? 还是没有定义high层?

定义high区了，只是省略了没列出来
赞一下 回复此楼
4楼2012-08-03 14:08:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

雨萍

银虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by keke1987 at 2012-08-01 16:58:03
楼主，问题解决了吗？请问有没有oniom计算实例可以分享下？高层是客体还是低层是客体呢？高低层的计算方法有分别要依据什么来定呢？

把反应活性中心放在QM区，把周围的环境放在MM区
赞一下 回复此楼
5楼2012-08-03 14:09:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

keke1987

新虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 雨萍 at 2012-08-03 14:09:44
把反应活性中心放在QM区，把周围的环境放在MM区...

哦，我是计算相互作用的，进行分层优化，不知道为什么老是出现2070错误
赞一下 回复此楼
6楼2012-08-04 18:25:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xpyp

木虫 (小有名气)
问题解决了吗?
回复此楼
7楼2013-08-25 10:24:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

太极夫人

新虫 (初入文坛)
问题解决了吗
回复此楼
8楼2015-05-04 10:38:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

太极夫人

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 雨萍 at 2012-08-03 14:09:44
把反应活性中心放在QM区，把周围的环境放在MM区...

问题解决了吗？遇到了同样的问题，想请教
赞一下 回复此楼
9楼2015-05-04 10:41:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

那年·时光飞

铁虫 (初入文坛)
我也是遇到103错误，就是构型不好，分子少的话比较好优化，但是分子多的话又总是出现103错误，楼主有没有什么办法帮助优化构型呢
赞一下 回复此楼
10楼2015-11-07 09:10:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 雨萍 的主题更新
101/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 086000生物与医药求调剂 +3 老天眷顾之人 2026-03-31 3/150 2026-04-05 22:24 by syh9288
[考研] 308求调剂 +3 终不似从前 2026-04-05 3/150 2026-04-05 22:23 by hemengdong
[考研] 材料专硕322分 +10 哈哈哈吼吼吼哈 2026-04-04 10/500 2026-04-05 21:22 by 学员8dgXkO
[考研] 285求调剂 +4 恶法大二的气味� 2026-04-05 5/250 2026-04-05 20:32 by 286640313
[考研] 工科08-机械专硕-求调剂 +3 雷欧飞踢 2026-04-02 3/150 2026-04-05 18:49 by 蓝云思雨
[有机交流] 甲醇/二氯 1:15过柱子 5+3 a哎y呦w喂 2026-03-31 3/150 2026-04-05 10:42 by 88817753
[考研] 268求调剂 +8 你好tg 2026-04-03 9/450 2026-04-04 05:08 by gswylq
[考研] 化学调剂求助 +6 LULONG1 2026-04-03 6/300 2026-04-03 23:13 by qzxyhcsy
[考研] 350一志愿北京航空航天大学08500材料科学与工程求调剂 +5 kjnasfss 2026-04-03 5/250 2026-04-03 22:29 by 无际的草原
[考研] 11408，284分，二战真诚求调剂 +4 12.27 2026-04-02 4/200 2026-04-03 14:14 by dxiaoxin
[考研] 求调剂 +3 usbdndj 2026-04-03 3/150 2026-04-03 14:10 by dxiaoxin
[硕博家园] 求老师收留 +9 lllq123 2026-04-03 9/450 2026-04-03 13:48 by 呼吸都是减肥
[考研] 286求调剂 +7 Faune 2026-03-30 7/350 2026-04-03 10:14 by linyelide
[考研] 材料考研调剂 +10 Gs大王 2026-04-02 10/500 2026-04-03 09:47 by 遗忘消失的灆
[考研] 一志愿深大085601材料工程专业（专硕）300分可以调剂去哪 +8 10160315 2026-04-02 8/400 2026-04-03 09:36 by hypershenger
[考研] 一志愿a区211，085601-307分求调剂 +13 党嘉豪 2026-03-31 26/1300 2026-04-03 08:33 by 495374996
[考研] 环境工程297分求调剂一志愿杭高院 +15 GENJIOW 2026-03-31 16/800 2026-04-02 17:56 by cyh—315
[考研] 285求调剂 +11 AZMK 2026-04-01 11/550 2026-04-01 22:40 by peike
[考研] 085601英二数二求调剂 总分325 +4 余航航 2026-03-31 4/200 2026-03-31 17:38 by 唐沐儿
[考研] 313求调剂 +6 卖个关子吧 2026-03-31 6/300 2026-03-31 10:58 by Jaylen.
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭