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Gaussian09 优化得到的氢键的数据能够用在文章中吗？已有1人参与
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文章主要讨论新催化剂催化反应的结果。 为了发更高的杂志，老板想搞计算，计算氢键的作用强弱，主要是计算催化剂和单体之间氢键的作用强弱，一个催化剂和一个底物。 本人，对计算就是一个小白。模仿文献的方法进行类似的计算。 平台：windows 7 64位 英特尔 E3 1230V2 16G内存 SSD：浦科特M5S 128G （自己组装的电脑） 软件：chemdraw3D 画分子式，优化最低能量----导入 GaussView 5.0，设置计算方法----用Gaussian 09W 进行计算 计算方法：optimization -DFT- B3LYP-6-31+g pop=NBO geom=connectivity 目的：为了计算催化剂与单体的氢键作用的强弱（键长、键角，电荷），N-H对O=C 的氢键 问题： 1、不知道这样的计算是否可靠，方法是否有问题？应该怎么计算？ 2、单纯的optimization的得到的数据能否用于文章中，能够说明问题嘛？需要算能量吗？有什么更好的方法？ 3、自己网上的下的高斯软件，发文章（一区）有影响吗？ 求高人指点迷津，小弟感激不尽！！！！ |
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 计算化学 |
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2楼2014-04-17 22:31:36
枪下游魂
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1、氢键一般需要加BSSE矫正，什么是BSSE矫正？请google之。 2、这个基组我觉得小了，可以再加个弥散和极化。 3、发文章必须引用高斯要求你引用的文献，具体引用哪些文章，可以到官网的高斯手册里面找。NBO分析还要引用NBO相关的文献，手册里也提及了。 4、可以通过修改输入文件或.rou文件来调整运算所需的内存及CPU数目。比如%mem。%nprocshared等。不会写输入文件？google之 |
3楼2014-04-18 09:32:28
shangwu
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