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xzy760203

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助】关于氢键的数据表示 已有5人参与

请教高人:
在cif 文件中有以下相应的氢键数据,其中键长和键角
都能算出来,但是键角后面的“. yes”和“2_876 yes”分别表示是什么,如何能够求出来,我不清楚, 还请哪位高人指点,愿意奉送金币20。谢谢了,着急用。

loop_
_geom_hbond_atom_site_label_D
_geom_hbond_atom_site_label_H
_geom_hbond_atom_site_label_A
_geom_hbond_distance_DH
_geom_hbond_distance_HA
_geom_hbond_distance_DA
_geom_hbond_angle_DHA
_geom_hbond_site_symmetry_A
_gemo_hbond_publ_flag
N3 H3 N1  0.79(3) 1.96(3) 2.630(3) 143(3) . yes
N2 H2 S1  0.80(3) 2.62(3) 3.408(2) 170(3) 2_876 yes
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ljmmarise

至尊木虫 (著名写手)


wsht212(金币+1):谢谢交流,希望常来! 2010-07-26 21:18:54
xzy760203(金币+2): 2010-07-27 10:14:37
引用回帖:
Originally posted by xzy760203 at 2010-07-26 17:22:15:
请教高人:
在cif 文件中有以下相应的氢键数据,其中键长和键角
都能算出来,但是键角后面的“. yes”和“2_876 yes”分别表示是什么,如何能够求出来,我不清楚, 还请哪位高人指点,愿意奉送金币20。谢谢了, ...

你是投acta文章吧,那2个”yes"都是表示这2个氢键的数据列到出版的表格中,后面没有yes的氢键不在文章中氢键表中出版。
2楼2010-07-26 18:01:44
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yy0520yy

金虫 (职业作家)


wsht212(金币+1):谢谢交流,希望常来! 2010-07-27 09:52:21
xzy760203(金币+5): 2010-07-27 10:14:49
yes前没有四位数字的是分子内氢键,有的是分子间氢键,yes如楼上所属,是表示有必要在文章中发表的(或者是经典氢键),有些no的如果在分子的堆积结构中起到比较重要的作用的也是可以写的,
3楼2010-07-27 08:01:14
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韩松

木虫 (著名写手)

专利虫


wsht212:谢谢交流,希望常来! 2010-07-27 09:52:31
我的cif怎么没有啊   sup里有  还没有yes和no
4楼2010-07-27 09:49:04
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xzy760203

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by yy0520yy at 2010-07-27 08:01:14:
yes前没有四位数字的是分子内氢键,有的是分子间氢键,yes如楼上所属,是表示有必要在文章中发表的(或者是经典氢键),有些no的如果在分子的堆积结构中起到比较重要的作用的也是可以写的,

真的非常感谢你,还有个问题是:
N2 H2 S1  0.80(3) 2.62(3) 3.408(2) 170(3) 2_876 yes 中的“2_876”如何计算呐 ,望高手帮助解答
5楼2010-07-27 10:17:22
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yy0520yy

金虫 (职业作家)

xzy760203(金币+3):非常感谢 2010-07-27 14:36:59
yanhualover:谢谢交流 2010-07-27 20:20:57
引用回帖:
Originally posted by xzy760203 at 2010-07-27 10:17:22:


真的非常感谢你,还有个问题是:
N2 H2 S1  0.80(3) 2.62(3) 3.408(2) 170(3) 2_876 yes 中的“2_876”如何计算呐 ,望高手帮助解答

http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=962939
这个帖子对你可能会有帮助!
6楼2010-07-27 10:50:07
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etongtong

铁杆木虫 (著名写手)

yanhualover:谢谢交流 2010-07-27 20:20:49
引用回帖:
Originally posted by xzy760203 at 2010-07-27 10:17:22:


真的非常感谢你,还有个问题是:
N2 H2 S1  0.80(3) 2.62(3) 3.408(2) 170(3) 2_876 yes 中的“2_876”如何计算呐 ,望高手帮助解答

这是对称操作符号。表示所对应的氢键的氢不在同一单元里。
▄︻┻┳═一................................................
7楼2010-07-27 11:23:20
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etongtong

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by etongtong at 2010-07-27 11:23:20:

这是对称操作符号。表示所对应的氢键的氢不在同一单元里。

在ins 文件中加入HTAB运算后在LST文件中生成氢键数据里有的对称操作符号
▄︻┻┳═一................................................
8楼2010-07-29 09:13:19
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