应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » Material studio Dmol3 优化结构和 Gaussian09 NMR 计算
101/1返回列表
查看: 3649  |  回复: 9
只看楼主@他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

yungyu.ac97g

新虫 (初入文坛)

[求助] Material studio Dmol3 优化结构和 Gaussian09 NMR 计算

求助各位理論計算高手，我是?碜蕴硨W生，研究是有機合成，但是最近再碰理論計算的研究，想請問利用 Gaussian09 計算 NMR 前，优化结构可以用不同的軟體的 Material studio Dmol3 進行优化结构，所得的最佳结构，再利用 Gaussian09 計算 NMR ??
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

核壳催化剂2013-09-23

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼2013-11-08 16:42:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fubest

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
高斯算的结构比MS精确！直接用高斯算就好了啊
赞一下 回复此楼
2楼2013-11-08 22:12:19
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

飞行鸟

至尊木虫 (文坛精英)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
一般情形下高斯计算的气态，MS是固态。看你的需要
赞一下 回复此楼
快乐吧
3楼2013-11-08 22:16:53
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gmy1990

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
yungyu.ac97g: 金币+2, ★有帮助 2013-11-13 09:52:18
之前因为有计算需要用到MS，所以做过比较，前期MS计算，后期Gaussian计算，然后和全部用高斯计算的比较，结果差别很多，仅供参考。
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2013-11-09 00:28:42
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

beefly

专家顾问 (职业作家)

地沟油冶炼专家
★ ★
gmy1990: 金币+2 2013-11-09 07:19:12
有些情况下可以接受：

分子比较大，或者分子不大但是分子样本比较多，可以用dmol3的DFT算结构（或者还有频率），算性质用g09的新型泛函+大基组，或post-HF

主要用dmol3，dmol3没有的个别功能用g09算
赞一下 回复此楼
beefly《西太平洋大学现代英汉词典》[bi:fli]牛肉一般地
5楼2013-11-09 00:59:24
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yungyu.ac97g

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
5楼: Originally posted by beefly at 2013-11-09 00:59:24
有些情况下可以接受：

分子比较大，或者分子不大但是分子样本比较多，可以用dmol3的DFT算结构（或者还有频率），算性质用g09的新型泛函+大基组，或post-HF

主要用dmol3，dmol3没有的个别功能用g09算

真的很抱歉，沒說明我的情況，因為我是在投稿，被 reviewer 問否可以計算 NMR chemical shift，但是之前 compound 的結構都是用 Dmol3 進行优化结构，在短時間內要增加計算?K且回覆 reviewer 的問題。所以想直接利用  Dmol3 進行优化结构的結果去進行  NMR 計算�?驗。 不知道這樣是否可行 ?  也有聽過說 优化结构與 NMR 計算最好使用同一軟件 ?
赞一下 回复此楼
6楼2013-11-09 11:40:32
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

beefly

专家顾问 (职业作家)

地沟油冶炼专家
引用回帖:
6楼: Originally posted by yungyu.ac97g at 2013-11-09 11:40:32
真的很抱歉，沒說明我的情況，因為我是在投稿，被 reviewer 問否可以計算 NMR chemical shift，但是之前 compound 的結構都是用 Dmol3 進行优化结构，在短時間內要增加計算?K且回覆 reviewer 的問題。所以想直接利 ...

可以用不同的程序，但是得说明原因，比如：dmol3版本太旧不能算nmr；dmol3的nmr是错的；dmol3计算nmr和gaussian相比非常慢，等等
赞一下(2人) 回复此楼
beefly《西太平洋大学现代英汉词典》[bi:fli]牛肉一般地
7楼2013-11-09 12:00:23
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yungyu.ac97g

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
7楼: Originally posted by beefly at 2013-11-09 12:00:23
可以用不同的程序，但是得说明原因，比如：dmol3版本太旧不能算nmr；dmol3的nmr是错的；dmol3计算nmr和gaussian相比非常慢，等等...

感謝你的回覆!  2枚奖励金币我給了 gmy1990 ， 剩餘的 3枚奖励金币， 我想給你但是沒有選項 @@
赞一下(1人) 回复此楼
8楼2013-11-13 09:55:08
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪
额 Dmol的output能做Gaussian的analysis？
Gaussian的NMR也要Gaussian的output文件吧。。。
赞一下 回复此楼
#有问题发论坛，不接受私聊#爱晶体，爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
9楼2013-11-13 15:25:50
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yungyu.ac97g

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
9楼: Originally posted by pigrass at 2013-11-13 15:25:50
额 Dmol的output能做Gaussian的analysis？
Gaussian的NMR也要Gaussian的output文件吧。。。

Dmol 結構優化後的結構，輸出轉存為 .mol 的格式，此格式 Gaussian 可以讀取 Dmol 優化後的結構，再去進行 Gaussian NMR 計算。
赞一下 回复此楼
10楼2013-11-14 09:18:46
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 yungyu.ac97g 的主题更新
101/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭